El café y cacao colombianos gozan de un puesto privilegiado respecto a los productos de este renglón en el mundo, por su perfil sensorial, palatabilidad y suavidad. De acuerdo a las tendencias actuales del mercado de alimentos y bebidas, los productos con cualidades benéficas funcionales tienen preferencia entre los consumidores que buscan cuidar su salud. La incorporación de componentes bioactivos en los alimentos sólidos y en polvo, suele hacerse previa encapsulación del mismo de manera que se mejore su estabilidad durante el procesado, almacenamiento y consumo. Para ello, la tecnología y materiales de encapsulación son vitales en el éxito de las cualidades funcionales del producto. El objetivo del presente trabajo de investigación es diseñar y generar valor en productos probióticos a base de café y cacao, mediante la incorporación de Lactobacillus coagulans encapsulado aplicando las tecnologías de ventana de refractancia y secado por aspersión. Para ello se estudiará el mucilago y extracto de café como ingredientes en materiales pared, para la micro-encapsulación de la cepa probiótica termoestable de Lactobacillus coagulans. Se evaluarán propiedades de hidratación, solubilidad del encapsulado y la viabilidad y carácter probiótico de la cepa microencapsulada. Como métodos de encapsulación se evaluará el secado por aspersión y el secado por ventana de refractancia, en términos de eficiencia de microencapsulación, morfología de la cápsulas y porcentaje de incorporación del microorganismo probiótico. Se evaluará el efecto de la combinación de los materiales pared seleccionados y las tecnologías de microencapsulación (ventana de refractancia y secado por aspersión). Una vez evaluado el perfil sensorial y la aceptación de los productos formulados a base de café y cacao se desarrollarán sus prototipos. Adicionalmente, se evaluará el potencial funcional probiótico (in-vitro) de los prototipos y su vida útil. Como productos de este trabajo de investigación, se espera desarrollar seis prototipos de alimentos con cualidades funcionales a base de café y cacao, con la tipología definida por Colciencias. Se espera someter por lo menos dos artículos de investigación en revistas indexadas, formar en competencias investigativas en CT&I a por lo menos dos estudiantes de pre o posgrado. Finalmente, contribuir al conocimiento de la encapsulación de compuestos activos, al desarrollo y prototipado de nuevos productos probióticos y generar valor en las agrocadenas del café y cacao los productos agrícolas de la región.