Los estudios genéticos-poblacionales en peces marinos han permitido explorar sus modos de dispersión y la conectividad entre los hábitats. Entender los patrones de conectividad y la influencia de las barreras físicas en especies marinas, es útil en el diseño e implementación de áreas marinas protegidas, pues la comprensión de la variabilidad genética y el flujo génico entre poblaciones permite generar planes para preservar la diversidad genética e identificar y manejar stocks pesqueros . Dichos estudios se basan en que variantes alélicas en los mismos loci hacen diferir a las poblaciones y estas diferencias permiten inferir cuál es el grado de migración de individuos entre poblaciones. Así mismo, el flujo génico en peces marinos está determinado por procesos estocásticos, entre los que se resaltan, la dispersión larval, la historia de vida de cada especie, y factores oceanográficos . En el presente trabajo se pretende determinar si existe un patron de estructuración genética en las especies Haemulon aurolineatum y Haemulon steindachneri (Teleostei: Haemulidae) a lo largo del Caribe Colombiano (Guajira, Santa Marta, Golfo de Morrosquillo y Capurganá), empleando marcadores moleculares tipo microsatélite. Dado que ambas especies son desovadoras pelágicas de mediana talla co-distribuidas en aguas someras del Caribe colombiano, pero con preferencias ecológicas diferentes, el presente estudio pretende investigar la posible influencia de la ecología en el flujo genético. Finalmente este estudio pretende a su vez generar herramientas para el manejo y conservación de estas especies de importancia pesquera en el área de estudio.