Colombia posee varias razas reconocidas como ganado criollo: Romosinuano, Costeño con Cuernos, Blanco Orejinegro, Chino Santandereano, Hartón del Valle, Casanareño, Caqueteño y San Martinero (Martínez, 2002). Así mismo, se reconocen dos razas colombianas formadas por cruzamiento con ganado criollo: Velázquez y Lucerna (ASOCRIOLLO, 2007). Colombia posee la mayor variedad de bovinos criollos de América sin embargo, el Censo Nacional de Razas Criollas estimó en todo el país 23.415 individuos criollos de un total de 24 millones en el inventario nacional. Las razas criollas han sido sometidas constantemente a cruzamientos graduales de absorción hacia ganado cebuino o taurino, ocasionando disminución en las poblaciones puras e introgresión con razas foráneas tanto Bos taurus como Bos indicus. De acuerdo con el tamaño poblacional, la mayoría de las razas criollas colombianas se encuentran clasificadas como vulnerable (Blanco Orejinegro, Hartón del Valle, Casanareño, Sanmartinero, Lucerna, Velásquez y Romosinuano), en peligro de extinción (Costeño Con Cuernos y Chino Santandereano) y critica (Caqueteño) (Martínez, 1999; Duran y Manrique, 1999; Salamanca, 1999). Con excepción de trabajos realizados en ganado Hartón del Valle, no se conocen estudios enfocados al conocimiento de los genes que afectan la calidad de la leche en razas criollas colombianas. Por lo anterior se pretende estudiar la variabilidad de los genes de las proteínas, k-caseína, b-lactoglobulina y a-lactoalbúmina en razas criollas, mediante la técnica molecular: Reacción en cadena de la polimerasa y polimorfismos conformacionales de cadena única (PCR-SSCP). El presente estudio se llevara a cabo en el laboratorio de Biología Molecular de la Universidad Nacional de Colombia-Sede Palmira mediante muestras de 30 individuos por raza de cada una de razas criollas: Blanco Orejinegro, Sanmartinero, Costeño con Cuernos, Romosinuano, Chino Santandereano, Casanareño, Caqueteño, Lucerna y Velásquez. Se espera que los genes relacionados con la proteína de la leche presentes en las razas criollas colombianas presenten: alta variabilidad, alta proporción de los alelos deseables y diferencias en las frecuencias entre las razas. El estudio de la diversidad genética de las razas criollas colombianas es trascendental para el conocimiento de este patrimonio nacional y generar razones convincentes ante los productores para su conservación, valoración y uso como recurso potencial en la seguridad alimentaría. A través de la identificación de sus atributos se puede inducir la prospección y por ende el incremento del inventario ganadero. Además, el estudio, conservación y mejoramiento de la utilización de recursos genéticos adaptados como las razas criollas colombianas es indispensable para alcanzar y mantener sistemas de producción sustentables que sean capaces de responder a las necesidades del hombre en la seguridad alimenticia a niveles nacional y mundial.