El cultivo del aguacate lo afecta una amplia variedad de especies de thrips, en México se han registrado 85 especies de thrips sobre estructuras florales y foliares, tanto fitófagas como depredadoras por lo que se puede asegurar que este cultivo es apetecible para éstos insectos (Johansen et al 2003). Muchos estudios se han realizado para determinar morfológicamente estas especies de thrips sin embargo tanto para planes de manejo integrado de plagas como en programas de cuarentena vegetal es necesaria la rápida, eficaz y precisa identificación de insectos exóticos o potencialmente invasivos que pueden causar altas pérdidas económicas o daños ambientales (Rugman-Jones et al 2010). La identificación de especímenes a partir de su morfología puede ser difícil, debido a problemas intrínsecos en ciertos grupos con plasticidad fenotípica, diferencias ontogénicas y dimorfismo sexual, entre otros. (Crawford et al 2011) Por estos motivos es importante combinar herramientas morfológicas y moleculares que permitan mayor precisión en los diagnósticos y generen un conocimiento más amplio de las especies de thrips presentes en el cultivo del aguacate. Un diverso rango de marcadores moleculares está disponibles para investigaciones en entomología, ésta técnica ha revolucionado las ciencias biológicas y han mejorado muchos campos de estudio especialmente la ecología, donde tienen una amplia gama de aplicaciones, muchas de las cuales implican discriminaciones intra e interespecíficas. (Loxdale, et al 1998). “El ADN mitocondrial (mt) es un marcador molecular para estudios evolutivos de animales que incluye inferencias filogenéticas, identificación de origen de especies, filogeografía, análisis de estructura, dinámica poblacional y evolución molecular”. (Zhang, 1997). Igualmente, los análisis basados en las Regiones ITS2 de los ADN ribosomales han mostrado su utilidad para aclarar la filogenia en taxa de difícil clasificación. Por todas las dificultades que presenta la identificación morfológica de los thysanopteros y el desconocimiento que en el momento se tiene de la diversidad de especies presentes en los aguacates, se hace necesario llevar a cabo el presente estudio que combinara el uso de la taxonomía clásica por caracteres morfológicos, con el uso de los marcadores moleculares, con el objetivo de tener un amplio panorama acerca de las especies de thrips tanto fitófagas como depredadoras y de las principales especies de thrips que abundan en el Valle del Cauca, además de disponer de métodos de identificación más rápidos y eficaces.