En Colombia las bananas son uno de los principales cultivos agrícolas en ciertas regiones del país principalmente en el Urabá Antioqueño y Magdalena Medio (Restrepo, 2009). Valle del Cauca Sevilla, Caicedonia, Buga, Argelia y Cartago; con una producción de 46479 Ton (Acevedo, 2007). Eje cafetero Caldas y, zona rural de Manizales Quindío con una producción de 15.975 Ton (Agatón & Mejía, 2002). Como cultivo asociado se siembra en casi la mayoría del territorio nacional, siendo especialmente importante en regiones como la costa pacífica (CENICAFE 1989). La relación genética entre las bananas se ha estudiado usando diferentes métodos moleculares entre ellos están los RAPD y los SRAP (Phothipan, 2005) AFLP (Wong et al; 2002) usando también ISSR (Lu et al; 2011). Se han realizado estudios que comparan el uso de marcadores micro satélites y características morfológicas estimando la relación genética entre cultivares de banana (Changadegadeya, 2012), (Psyquay et al; 2009). Se han realizado estudios importantes en bananas con el método de micro Satélites Amplificados al Azar. Se han aislado y caracterizado micro satélites loci polimórficos para Musella lasiocarpa (Yang et al; 2009) y para Musa acuminata (Creste et al; 2005). Los micro satélites se utilizan para conocer la variación morfológica y tolerancia por parte de la planta a una enfermedad e.g. Cultivares de bananas desertícolas con tolerancia al marchitamiento por fusarium (Pushpakumari, 2009). Los marcadores RAMS son muy importantes como resultado del elevado nivel de polimorfismo, carácter codominante y facilidad de aplicación y alta reproducibilidad (Muñoz 2008). El establecimiento de los bancos de germoplasma es una práctica común, para conservar especies raras y amenazadas. En los bancos de germoplasma se conserva el material vegetal: semillas, polen, ADN, y cultivos invitro (Iriondo, 2001). El germoplasma es caracterizado usando la diversidad genómica de sus cultivares. La diversidad fenotípica también es llamada variación morfológica o fenotípica, esta variación se refiere a las características físicas o fenotípicas del organismo, tales como diferencias, anatómicas, fisiológicas, bioquímicas o en características de comportamiento (Williams & Humpheries, 1996). Con el avance de la ingeniería genética en el aislamiento, secuenciación y transferencia de genes, se hace necesario el establecimiento de grandes bancos de genes para su conservación. En Colombia el 70% de las accesiones vegetales en condiciones ex situ de los bancos nacionales se conservan en Corpoica (Vallejo & Estrada 2002).