En los últimos años se ha evidenciado una creciente inquietud por el manejo de residuos orgánicos en Colombia, estos desechos son producto de actividades agrícolas, postcosecha, transformación, transporte y comercialización, se pierde una cantidad considerable en su comercialización debido a factores climáticos, empaque inadecuado, demoras en el descargue entre otros, situación que ha generado la acumulación de residuos de materia orgánica agrícola en los centros de acopio municipales; la FAO reportó pérdidas de alimentos que alcanzan 156 toneladas diarias en todas las centrales de abastos del país, siendo el mayor porcentaje de su peso integrado por verduras y hortalizas, y 26 toneladas diarias conformadas por frutas (FAO 2010). A raíz de la problemática se han implementado normas ambientales para la regularización de estos residuos, sin embargo por el alto volumen de residuos los desafíos para el manejo y disposición de los residuos son enormes y toda acción en este frente debe estar encaminada a disminuir el impacto negativo sobre el ambiente y calidad de vida de las personas. En adición al problema anterior se le suma la necesidad de encontrar formas de energía renovable que no generen contaminación como los provenientes del carbón y derivados del petróleo. La producción de biogás y bietanol como fuente de energía limpia, por medio de un proceso de fermentación anaerobia ha surgido como una alternativa viable a esta problemática. Así, el presente proyecto integra un aprovechamiento de biomasa para su transformación básica para la generación de biocombustibles por fermentación anaerobia integrando en etapas de hidrólisis pretratamientos enzimático para la modificación de polímeros complejos e incrementar sustratos disponibles para el consumo bacteriano en rutas fermentativas para biogás y bioetanol.