Las zonas costeras están altamente expuestas a recibir diversos tipos de contaminantes ambientales, entre ellos los metales pesados que pueden integrarse al medio marino a partir de fuentes naturales (deposición atmosférica) o antrópicas (Azad Mohammed et al, 2012). Este tipo de contaminación reviste una grave amenaza para los ecosistemas acuáticos, ya que los metales poseen características como: su naturaleza persistente, el transporte a larga distancia y la toxicidad que genera para los organismos acuáticos, al exceder los límites fisiológicos requeridos. En la bahía desembocan ríos que traen consigo un gran volumen de agua y sedimentos con diferentes tipos de contaminantes, entre los que se encuentran los metales pesados, que al no ser biodegradables se depositan y acumulan en el lecho marino incorporándose a las redes tróficas por procesos de bioacumulación y biomagnificación, estos tienden a acumularse en los tejidos de animales y vegetales acuáticos y permanecen en ellos por largos períodos, desencadenando procesos de biomagnificación teniendo como último receptor el hombre, los alimentos son la ruta de mayor exposición de químicos tóxicos en las poblaciones humanas y los peces han sido reconocidos como el mayor vector para la transferencia de contaminantes humanos. Dado lo anterior este proyecto busca exponer la presencia de metales pesados en los sedimentos y peces del ecosistema y su relación con las variables ambientales y biológicas, para comprender la dinámica de la concentración de estos contaminantes en una escala de tiempo y espacio.