La infección por el virus del papiloma humano (VPH) es la infección de transmisión sexual más común en Colombia y el mundo. Dependiendo del serotipo responsable de la infección, el VPH puede manifestarse en forma de verrugas o inducir carcinogénesis. Es importante destacar que los serotipos de alto riesgo están asociados con diversos tipos de cáncer, incluyendo el cáncer de cuello uterino, que ha presentado una incidencia estimada de 38.000 casos diagnosticados por año a nivel mundial (Paver et al., 2020). En los últimos años, se ha observado un aumento significativo en los casos de cáncer orofaríngeo que no se relaciona con el tabaquismo o el consumo de alcohol, considerados como los principales factores de riesgo para esta enfermedad, sino al incremento de conductas sexuales de riesgo como un alto número de parejas sexuales y prácticas de sexo oral, que han conducido al aumento de las infecciones de transmisión sexual (ITS), incluyendo el VPH. Se ha encontrado una causalidad directa entre la infección por este virus y el desarrollo del carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello (HNSCC, por sus siglas en inglés), principalmente en orofaringe. Esta asociación se manifiesta de manera clínica y molecularmente diferente en comparación con los casos donde no se encuentra esta vinculación (Gillison et al., 2015). El proyecto busca identificar biomarcadores transcripcionales en pacientes con cáncer orofaríngeo y validar los hallazgos en pacientes colombianos.