El cultivo de tomate (Solanum lycopersicon L) es atacado por un gran número de plagas como el pasador del fruto (Neoleucinoides elegantalis), gusano cogollero (Tuta absoluta), la mosca blanca (Trialeurodes vaporarium y Liriomiza spp), entre otros. El pasador del fruto causa pérdidas del 70% en cultivos en el Valle del Cauca. Debido al daño causado por estas plagas, en la actualidad se realizan un gran número aplicaciones de insecticidas que en muchos casos generan serios problemas de salubridad. En la búsqueda de fuentes de resistencia en el cultivo del tomate, el programa de Hortalizas de la Universidad Nacional sede Palmira ha realizado cruzamientos interespecíficos entre Solanum lycopersicon L y especies silvestres Solanum spp, observando una estrecha relación entre resistencia y tamaño pequeño de fruto. Por esto se pretende generar una variedad resistente al pasador del fruto del tomate, utilizando retrocruzamiento y selección recurrente con el fin de obtener líneas isogenicas resistentes y de buenas características agronómicas. Estas líneas se obtendrán con ayuda de marcadores moleculares asociados a resistencia al pasador del fruto, disminuyendo costos y tiempo en la selección. Para ello se pretende obtener determinates genéticos asociados a resistencia al pasador del fruto mediante la aplicación de la técnica diferencial display (cDNA-AFLP), con los que se van a generar marcadores asociados a esta plaga con el fin de aplicarlos en un programa de selección asistida por marcadores moleculares, con el fin de hacer en el futuro cruzamientos dirigidos y diagnóstico temprano de las características deseadas, sin tener que esperar a que la planta sea adulta.