Lippia origanoides, Kunth, es un arbusto de la familia Verbenaceae. Esta familia se caracteriza por la gran variabilidad de usos que presentan sus especies por su alto contenido de aceites volátiles. El Centro Nacional de Investigaciones para la Agroindustrialización de Especies Vegetales Aromáticas y Medicinales Tropicales (CENIVAM) patrocinado por COLCIENCIAS ha identificado a L. origanoides como promisoria por la calidad de sus aceites esenciales. Sin embargo, es muy poco lo que se conoce sobre aspectos básicos de su biología como son su diversidad y estructura genética. En Colombia, L. origanoides se distribuye en zonas áridas y presenta registros de herbario en el Cañón del Río Chicamocha, en la región de la Costa Atlántica (Magdalena y Guajira) y en los Valles Interandinos. El conocimiento de cómo la diversidad genética se distribuye dentro y entre poblaciones es el primer paso para el eficiente aprovechamiento y conservación de los recursos fitogenéticos promisorios. Recientes estudios, aún no publicados, sobre la diversidad y estructura genética de la población de L. origanoides del Cañón del Chicamocha revelaron niveles relativamente altos de diversidad genética y un patrón moderado pero significativo de estructura genética espacial con base en marcadores ISSR. En el presente proyecto se propone realizar un estudio comparativo de la diversidad y estructura genética de L. origanoides en dos poblaciones del norte de Colombia (departamento del Magdalena y Cañón del Río Chicamocha) con base en marcadores del genoma nuclear y del genoma cloroplástico. Adicionalmente, se propone explorar la posible asociación entre la estructura genética en esta especie y la composición química de sus aceites esenciales, información que es básica en el desarrollo de posibles nuevos cultivos. El presente proyecto espera contribuir al conocimiento sobre esta especie y guiar futuras actividades de propagación y aprovechamiento.