Los procesos de domesticación en Phaseolus lunatus, el fríjol Lima, aún no se conocen con claridad, esto se debe principalmente a la poca información que se ha generado principalmente sobre las características fenotípicas y regiones del genoma que diferencian a las poblaciones silvestres y domesticadas. Por lo tanto, una evaluación fenotípica y genómica en la especie se hace imprescindible para un mejor entendimiento de la domesticación de P. lunatus y para futuros programas de mejoramiento. En el presente estudio se busca determinar los rasgos morfológicos, fenológicos y de rendimiento asociados con el síndrome adaptativo de la domesticación en fríjol Lima e identificar regiones genómicas asociadas con estos cambios. Para cumplir con los objetivos planteados se evaluarán 50 accesiones de fríjol Lima silvestre y domesticado provenientes de diversas regiones geográficas de las Américas. Cada accesión será sembrada bajo condiciones de altura y temperatura similares a su zona de origen. Se evaluarán un total de 20 variables fenotípicas en cada una de 20 plantas por accesión y luego estas variables se compararán entre las accesiones silvestres y domesticadas. Asimismo se comparará la diversidad del genoma entre las accesiones silvestres y domesticadas mediante polimorfismos de nucleótidos simples o SNPs. Finalmente, se realizarán pruebas de asociación entre las variables fenotípicas y los SNPs detectados con el fin de detectar regiones del genoma que están relacionadas con el síndrome adaptativo de la domesticación. Los resultados de este estudio proveerán un mayor entendimiento de los aspectos fenotípicos en P. lunatus, así como también del proceso de adaptación de las poblaciones de fríjol Lima a su ambiente natural y de cultivo. Este estudio será la base para posteriores estudios en la especie, servirá como herramienta para programas futuros de mejoramiento y aportará información valiosa para entender el proceso de domesticación e información inestimable para un mejor aprovechamiento de las especies vegetales poco explotadas hasta ahora.