Proyectos
Variabilidad alélica y expresión génica de genes candidatos de resistencia y su relación con la susceptibilidad a la bacteriosis vascular de la yuca
Resumen
La yuca, Manihot esculenta Crantz, es uno de los cultivos más importantes del mundo, es base de la alimentación para cerca de 1.000 millones de personas y ha sido catalogado como un cultivo estratégico en la protección de la seguridad alimentaria de los países pobres. La producción de yuca se ve constantemente amenazada por diversas enfermedades, siendo la bacteriosis vascular de la yuca (CBB, cassava bacterial blight, por sus siglas en inglés) una de las enfermedades más limitantes. Para la CBB, la cual es causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam), no existe control químico, solo la siembra de variedades resistentes ha contribuido a disminuir las pérdidas en el cultivo. Dada la importancia de la yuca es perentorio explorar diferentes estrategias para identificar regiones genómicas involucradas en la resistencia a CBB y profundizar en el conocimiento de la interacción entre la planta y el patógeno, que puedan contribuir en el futuro a generar fuentes de resistencia. La estrategia de investigación que aborda este proyecto se basa en explotar la información genotípica de polimorfismos tipo SNP (single nucleotide polymorphism) que reside en bases de datos de acceso libre de un panel diverso de accesiones de yuca. En estas bases de datos se buscará la variabilidad alélica natural presente en algunos genes candidatos a CBB previamente identificados en nuestro grupo. Paralelamente, se realizará una evaluación de la respuesta fenotípica a la infección por cepas de Xam en un panel de accesiones de yuca seleccionadas, bajo condiciones in vitro, para determinar el nivel de contribución de la variabilidad alélica de genes candidatos a la variabilidad de la respuesta fenotípica de la yuca frente a Xam. Finalmente, a través de qRT-PCR, se determinará si la expresión génica de estos genes candidatos es significativamente diferencial en acervos genéticos de yuca, resistentes y susceptibles a CBB. La evaluación de la respuesta a CBB bajo condiciones in vitro se plantea como una estrategia rápida y eficaz de fenotipificación. Los resultados obtenidos en este proyecto de investigación serán base para futuros estudios de asociación amplia del genoma en yuca en cuanto a que se obtendrá la fenotipificación de un panel diverso de accesiones de esta especie. Además, se espera que este trabajo sea un referente de abordaje de estudio para otros patosistemas.
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:Convocatoria externa
Modalidad:Convocatoria externa
Responsable