Plan de trabajo: I. Identificación de genes candidatos responsables por características de importancia zootécnica. Es así, como los bancos de Germoplasma animal nacieron de la necesidad de conservar razas que a lo largo de muchos años han desarrollado características importantes de adaptación al medio ambiente tropical. Estos Bancos se convierten en un recurso valioso en la medida que se identifiquen genes que controlan una característica en particular. Generalmente se habla del caso de las características de adaptación que son de naturaleza poligénica y que están controladas por genes de acción no aditiva. En el caso de la identificación de Genes asociados a caracteristicas de producción, se utilizaran tecnologías como la genomica, transcriptomica y proteomica entre otras con el fin de identificar aquellas redes intergenicas responsables por la variación en el fenotipo. II. En el campo del diagnostico genético medico-veterinario: Desarrollo de técnicas mas especificas y sensibles para el diagnostico de las principales entidades de origen genético de los animales domésticos. Se desarrollaran pruebas basadas en la técnica de PCR, hibridación de ácidos nucleicos y microchips de ADN para la identificación de mutaciones puntuales responsables por variaciones en los diferentes fenotipos. III. Salud publica Utilización de marcadores moleculares tipo ADN mitocondrial y microsatélite para la diferenciación entre músculos de las especies bovina, porcina, equina, canina y aviar Esta area de la genética molecular pretende ofrecer un soporte al diagnostico en el área de la salud publica mediante la identificación de la especie de origen animal de la carne utilizada para el consumo humano, por medio del empleo de marcadores moleculares tipo ADN mitocondrial y microsatélite; marcadores que por su especificad de especie son aprovechados para este tipo de estudios. Dichas características de estos le aseguran al consumidor que el producto que eligió para dicho fin. III. Estudios en calidad de la carne Estado del arte: I. EL MEJORAMIENTO ASISTIDO POR MARCADORES MOLECULARES Hasta hace un poco mas de una década, la mayoría del mejoramiento genético en las poblaciones de ganado se realizaba gracias a la selección de los individuos, basada tanto en el fenotipo como en sus valores genéticos, y por lo tanto desconociéndose la información directamente suministrada por los genes que afectan rasgos específicos y los efectos de genes individuales (Dekkers and Frederic, 2002). El objetivo del análisis genético moderno es identificar los genes o los sitios en el genoma responsables de la variación genética de las características de interés pecuario. Muchos de los genes que afectan los rasgos cuantitativos han sido identificados por casualidad, debido a que el efecto de los alelos es lo suficientemente grande para facilitar su reconocimiento por segregación individual. Ejemplos de éstos casos particulares, son los alelos del gen de la obesidad y del enanismo los cuales fueron localizados en líneas de ratones seleccionados por el tamaño del cuerpo (Roberts y Smith, 1982) y de la hormona del crecimiento (HC), en donde se produce una rápida ganancia de peso al post-destete, en una línea de ratones seleccionados para ganancia de peso (Bradford y Famula, 1984). Dentro de las especies domésticas han sido identificados genes potencialmente responsables por la variación del fenotipo a través del uso de los marcadores moleculares, tal es el caso de la mutación autosomal del gen de la fecundidad en ovejas (FecB o Booroola), el cual incrementa la tasa de ovulación y el numero de crías, debido a los efectos asociados con la fisiología de los ovarios y los perfiles hormonales (Bindon and Piper., 1986a; b). Esta asociación con el locus FecB se identificó después de analizar 145 marcadores y su desarrollo requirió tres años. LA REVOLUCION DE LAS OMICAS Con la secuenciación del genoma humano se han desarrollado nuevas tecnologías que están revolucionando la biomedicin

• ESTUDIOS EN CALIDAD DE LA CARNE
• GENÉTICA CUANTITATIVA
• MICROBIOLOGÍA, APICULTURA Y CIENCIAS APÍCOLAS
• ENFERMEDADES DE ORIGEN GENÉTICO EN LOS ANIMALES DOMESTICOS
• GENÉTICA MOLECULAR POBLACIÓNAL

I. EL MEJORAMIENTO ASISTIDO POR MARCADORES MOLECULARES Hasta hace un poco mas de una década, la mayoría del mejoramiento genético en las poblaciones de ganado se realizaba gracias a la selección de los individuos, basada tanto en el fenotipo como en sus valores genéticos, y por lo tanto desconociéndose la información directamente suministrada por los genes que afectan rasgos específicos y los efectos de genes individuales (Dekkers and Frederic, 2002). El objetivo del análisis genético moderno es identificar los genes o los sitios en el genoma responsables de la variación genética de las características de interés pecuario. Muchos de los genes que afectan los rasgos cuantitativos han sido identificados por casualidad, debido a que el efecto de los alelos es lo suficientemente grande para facilitar su reconocimiento por segregación individual. Ejemplos de éstos casos particulares, son los alelos del gen de la obesidad y del enanismo los cuales fueron localizados en líneas de ratones seleccionados por el tamaño del cuerpo (Roberts y Smith, 1982) y de la hormona del crecimiento (HC), en donde se produce una rápida ganancia de peso al post-destete, en una línea de ratones seleccionados para ganancia de peso (Bradford y Famula, 1984). Dentro de las especies domésticas han sido identificados genes potencialmente responsables por la variación del fenotipo a través del uso de los marcadores moleculares, tal es el caso de la mutación autosomal del gen de la fecundidad en ovejas (FecB o Booroola), el cual incrementa la tasa de ovulación y el numero de crías, debido a los efectos asociados con la fisiología de los ovarios y los perfiles hormonales (Bindon and Piper., 1986a; b). Esta asociación con el locus FecB se identificó después de analizar 145 marcadores y su desarrollo requirió tres años. O'Brien (1995) y O'Brien et al., (1993) identificaron en cerdos el gen del halotano o el receptor de la rianodina como el directo responsable por la variación en el fenotipo de la hipertermia maligna del cerdo.

I. Identificacion de genes candidatos responsables por caracteristicas de importancia zootecnica Los bancos de Germoplasma animal nacieron de la necesidad de conservar razas de animales que en el transcurso de muchos años han desarrollado características importantes de adaptación al medio ambiente tropical. Estos Bancos se convierten en un recurso valioso en la medida que se identifiquen genes que se relacionan o que controlan una característica en particular. Generalmente se habla del caso de las características de adaptación que son de naturaleza poligénica y que están controladas por genes de acción no aditiva. II. En el campo del diagnostico genetico medico-veterinario: Desarrollo de tecnicas mas especificas y sensibles para el diagnostico de las principales entidades de origen genetico de los animales domésticos. Se desarrollaran pruebas basadas en la técnica de PCR e hibridacion de acidos nucleicos para la identificacion de mutaciones puntuales responsables por variaciones en los diferentes fenotipos. III. Salud publica Utilización de marcadores moleculares tipo ADN mitocondrial y microsatélite para la diferenciación entre músculos de las especies bovina, porcina, equina, canina y aviar Esta area de la genética molecular pretende ofrecer un soporte al diagnostico en el área de la salud publica mediante la identificación de la especie de origen animal de la carne utilizada para el consumo humano, por medio del empleo de marcadores moleculares tipo ADN mitocondrial y microsatélite; marcadores que por su especifidad de especie son aprovechados para este tipo de estudios. Dichas caracterisiticas de estos le aseguran al consumidor que el producto que eligió para dicho fin realmente pertenece a la especie seleccionada.

Dado el continuo desarrollo de nuevas tecnologias en el area de la genetica y teniendo en cuenta que en el momento nos encontramos en la era de la genomica, el grupo de investigacion Genetica Molecular Animal ha trazado vinculos con diversos grupos de investigacion y ademas de ello se ha contactado con grupos del exterior con el fin de trabajar conjuntamente en desarrollos que den un auge cientifico en el area de la biologia molecular y mas especificamente en el area de la genomica animal asociada a la calidad de la carne.

Identificación de genes candidatos, asociados a la ausencia de huesos intermusculares en Cachama blanca (Piaractus brachypomus) originaria de la región Amazónica y de la Orinoquia

Centro de Excelencia en Genómica y Bioinformática de la Universidad Nacional de Colombia - CEGBio

Evaluación de polimorfismos de nucleótidos simples en los genes candidatos Oxido Nítrico Sintasa y Endotelina 1, asociados con Hipertensión Arterial Pulmonar en pollos de engorde

ASOCIACION DE POLIMORFISMOS DE NUCLEOTIDO SIMPLE DE LOS GENES MYF5 E IGF1 A CARACTERISTICAS DE CRECIMIENTO MUSCULAR MEDIDAS POR ULTRASONIDO EN EL GANADO CRIOLLO ROMOSINUANO Y SU CRUCE

ASOCIACION DE POLIMORFISMOS DE NUCLEOTIDO SIMPLE DE LOS GENES MYF5 E IGF1 A CARACTERISTICAS DE CRECIMIENTO MUSCULAR MEDIDAS POR ULTRASONIDO EN EL GANADO CRIOLLO ROMOSINUANO Y SU CRUCE

Identificación de genes asociados a características de terneza de la carne e implementación preliminar de un programa de selección asistida por marcadores moleculares y su impacto económico en ganaderías de la microregión del sur del Cesar.

Evaluación del efecto del tiempo de maduración sobre la colorimetría de los músculos Longissimus dorsii y Semitendinoso en diferentes cruces con ganado cebuino.

Evaluación del efecto del tiempo de maduración sobre la terneza de los músculos Longissimus dorsii y Semitendinoso en diferentes cruces con ganado cebuíno

HERRAMIENTAS PARA EL FORTALECIMIENTO DE LOS GRUPOS INTERSEDES GENÉTICA MOLECULAR ANIMAL Y RECURSOS ZOOGENÉTICOS PALMIRA MEDIANTE EL DESARROLLO DE LA CARACTERIZACION DE GENES ASOCIADOS A FENOTIPOS DE CALIDAD DE LA CARNE, EN RAZAS BOVINAS CRIOLLAS.

GENÉTICA MOLECULAR ANIMAL

--DETERMINACION DEL GRADO DE AFRICANIZACIÓN DE ABEJAS Apis mellifera EN TRES REGIONES DE COLOMBIA

Evaluación Genómica Asociada al síndrome de hipertensión pulmonar en pollos de engorde en condiciones de hipoxia

Identificación de Polimorfismos de Nucleótido Simple (SNPs) asociados a la terneza de la carne la carne de Camuro criollo Colombiano.

Obtención de un producto cárnico de conejo bajo esquema de producción orgánica familiar en la provincia de Sumapaz.

Aproximación a un sistema biológico computacional para la Genética y la Genomica en el ganado como herramienta de enseñanza para la Produccion animal.

• Evaluación del crecimiento y canal en ovinos de pelo en los departamentos de Córdoba, Cesar y Valle del Cauca (Artículo corto)
• Predicción de caracteristicas en la canal de ovinos Pelibuey usando medidas morfométricas en pie (Artículo corto)
• Genomic association study for adaptability traits in four colombian cattle breeds (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Polimorfismos de los genes CAPN1, CAST, DES, PRKAG3 y RYR1 asociados a la capacidad de retención de agua en crudo y cocinado en carne de bovino en cruces Bos indicus y Bos taurus en Colombia (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Molecular detection of Melissococcus plutonius assessed in Africanized honey bee populations (Apis mellifera) in three regions of Colombia (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Diversidad genética del Ovino Criollo de Pelo Colombiano mediante el uso del marcador molecular de tipo polimorfismos de nucleótido simple (SNP) (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Polymorphisms of Candidate Genes to Growth in Two Populations of Colombian Creole Sheep (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Africanized honey bees in Colombia exhibit high prevalence but low level of infestation of Varroa mites and low prevalence of pathogenic viruses (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Linkage disequilibrium leves and allele frequency distribution in Blanco Oreginegro and Romosinuano Creole cattle using medium density SNP chip data (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Association of single nucleotide polymorphisms in CAPN1, CAST and MB genes with meat color of Brahman and crossbreed cattle (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• ASOCIACIÓN DE POLIMORFISMOS DE NUCLEÓTIDO SIMPLE DE LOS GENES ENDOTELINA 1, ÓXIDO NÍTRICO SINTASA ENDOTELIAL Y FACTOR INDUCIBLE POR HIPOXIA 1±, CON SÍNDROME DE HIPERTENSIÓN PULMONAR EN POLLOS DE ENGORDE (DIRECCIÓN DE TESIS)
• EVALUACIÓN DE LOS POLIMORFISMOS DE NUCLEOTIDO SIMPLE ASOCIADOS A CAMBIOS EN EL COLOR DE LA CARNE EN GANADOS BOS INDICUS Y CRUCES CON BOS TAURUS (DIRECCIÓN DE TESIS)
• EVALUACION DE MUTACIONES PUNTUALES EN LOS GENES CALPAINA (CAPN1) Y CALPASTATINA (CAST) ASOCIADOS CON TERNEZA DE LA CARNE EN GANADO CEBU Y SUS CRUCES (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• COMPORTAMIENTO EN TERNEZA Y COLOR DE CARNE BOVINA (BOS INDICUS) PREVIAMENTE MADURADA Y EMPACADA EN CONDICIONES DE ATMÓSFERAS MODIFICADAS DURANTE 21 DÍAS. (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• LA CALIDAD DE LA CARNE EN GANADERIAS COLOMBIANAS: COMPORTAMIENTO DE SNP DE LOS GENES CALPAINA Y CALPASTATINA ASOCIADOS A TERNEZA (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• EVALUACIÓN DEL EFECTO DEL TIEMPO DE MADURACIÓN SOBRE LA COLORIMETRÍA DE LOS MÚSCULOS LONGISSIMUS DORSI Y SEMITENDINOSUS EN DIFERENTES CRUCES CON GANADO CEBUINO (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• IDENTIFICACION DE GENES ASOCIADOS A CARACTERISTICAS DE TERNEZA DE LA CARNE E IMPLEMENTACION PRELIMINAR DE UN PROGRAMA DE SELECCION ASISTIDA POR MARCADORES MOLECULARES Y SU IMPACTO ECONOMICO EN GANADERIAS DE LA MICROREGION DEL SUR DEL CESAR, COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• EVALUACIÓN DEL EFECTO DEL TIEMPO DE MADURACIÓN SOBRE LA TERNEZA DE LOS MÚSCULOS LONGISSIMUS DORSI Y SEMITENDINOSUS EN DIFERENTES CRUCES CON GANADO CEBUÍNO (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• ASOCIACION DE POLIMORFISMOS DE NUCLEOTIDO SIMPLE DE LOS GENES MYF-5 E IGF-1 CON CARACTERISTICAS DE CRECIMIENTO MUSCULAR MEDIDAS POR ULTRASONIDO EN EL GANADO CRIOLLO ROMOSINUANO Y SUS CRUCES (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• POLIMORFISMOS DE LOS GENES CAPN1, CAST, DES, PRKAG3 Y RYR1 ASOCIADOS A LA CAPACIDAD DE RETENCIÓN DE AGUA EN CRUDO Y COCINADO EN CARNE DE BOVINO EN CRUCES BOS INDICUS Y BOS TAURUS EN COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• DETERMINATION OF THE AFRICANIZED MITOTYPES IN POPULATIONS OF HONEY BEES (APIS MELLIFERA L.) OF COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• ASOCIACION DE POLIMORFISMOS DE NUCLEOTIDO SIMPLE EN LOS GENES CAPN1, CAST, MB Y PRKAG3 A COLOR DE LA CARNE EN GANADO CEBU Y SUS CRUCES (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA NO RECONOCIDA POR COLCIENCIAS)
• Actividad antimicrobiana de propóleos obtenidos de cinco departamentos de Colombia frente a bacterias indicadoras de calidad microbiológica en alimentos (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• El jamón crudo curado y su tecnología en ovinos: Una revisión de sus aspectos y de la cadena ovina (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• DESARROLLO DE UN PRODUCTO CÁRNICO CRUDO CURADO A PARTIR DE PIERNAS DE OVINOS DE PELO (Tesis de maestría)
• DETECCIÓN DE PATÓGENOS CAUSANTES DE ENFERMEDADES DE IMPACTO EN APICULTURA Y DETERMINACIÓN DE LOS MITOTIPOS DE AFRICANIZACIÓN EN TRES REGIONES DE COLOMBIA (Tesis doctoral)