El Grupo de Investigación en Biotecnología Microbiana, nace en el año 1997 con el fin de integrar los trabajos independientes sobre microorganismos nativos y sus metabolitos, que se venían desarrollando en el Laboratorio de Microbiología de la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Colombia sede Medellín. Cuenta con dos líneas principales de Investigación: Aislamiento y caracterización de cepas nativas y desarrollo de herramientas biotecnológicas de orígen microbiano. Está conformado por profesores de las Escuelas de Biociencias, Geociencias y Química, de la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Colombia Sede Medellín. Las áreas estratégicas de investigación de este grupo incluyen la apropiación de metodologías de aislamiento de la microbiota nativa, evaluación de actividades enzimáticas, separación e identificación de metabolitos, desarrollo de herramientas bioprospectivas de origen microbiano y utilización de metodologías bioinformáticas para el análisis de genomas, transcritos y proteínas de origen microbial.

• VIROLOGÍA MOLECULAR
• AISLAMIENTO Y CARACTERIZACIÓN DE CEPAS NATIVAS CON POTENCIAL BIOTECNOLOGICO
• MICROBIOLOGÍA MOLECULAR
• BIOLOGÍA COMPUTACIÓNAL
• INGENIERÍA DE PROTEINAS
• AISLAMIENTO, PURIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE METABOLITOS Y ENZIMAS BACTERIANAS

El Grupo de Biotecnología microbiana tiene como objetivo la resolución de problemas en la industria y la agricultura a través de una aplicación multidisciplinaria de herramientas biotécnología. En particular, el grupo pretende articularse con la industria química, agropecuaria y de alimentos mediante la optimización de procesos microbiológicos a través de la aplicación de herramientas de biología molecular, ingeniería genética y bioinformática.

El grupo de Biotecnología Microbiana tiene un enfasis en las siguientes líneas de investigación: Aislamiento y caracterización de microorganismos productores de enzimas o metabólitos de interés industrial. Mejoramiento de enzimas mediante métodos de ingeniería de proteínas. Desarrollo y aplicación de herramientas computacionales para la resolución de problemas de biología molecular o farmacológicos. Desarollo de herramientas de diagnóstico para la detección de virus vegetales.

En la actualidad el grupo de Biotecnología Microbiana tiene fuertes lazos con los grupos de Biotecnología vegetal, Biotecnología Animal y Microbiología del suelo, con quienes se han desarrollado diversas investigaciones en conjunto. Igualmente, se han iniciado lazos con varias grupos de la Universidad de Antioquia en las líneas de Biología Computacional y Genómica. Tambien participamos en proyectos con Cenicafe y algunas aproximaciones con la industria privada. Internacionalmente, nuestro grupo trabaja de manera estrecha con el grupo de Biología estructural dirigido por el profesor Kalle Gehring, del Departamento de Bioquímica de la Universidad McGill en Canada. Otras colaboraciones incluyen el centro de Inmunologia y Cancer de la Universidad de Montreal (IRIC).

Detección molecular de virus de RNA en tejido foliar y semillas de tomate en Antioquia mediante RT-qPCR y LAMP

Identificación y caracterización genómica de los virus que infectan los cultivos de uchuva (Physalis peruviana) y gulupa (Passiflora edulis f. edulis) para el apoyo de los programas de manejo fitosanitario y certificación de semilla por sanidad viral en Antioquia

Desarrollo de una plataforma molecular y bioinformática para el diagnóstico de virus en cultivos y material de siembra de papa (Solanum tuberosum y S. phureja) en Antioquia

CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DEL VIROMA DE PLANTAS SOLANÁCEAS DE IMPORTANCIA ECONÓMICA EN ANTIOQUIA

Caracterización genómica de virus de RNA que infectan Solanum tuberosum en Antioquia utilizando Secuenciación de Nueva Generación (NGS)

Mejoramiento de la estabilidad térmica de una alfa-amilasa obtenida de a partir cepa nativa de Bacillus licheniformis.

Purificación y caracterización de fitasas fúngicas de uso potencial en alimentación animal.

Comparación molecular de los Potyvirus asociados a los cultivos de tomate de árbol y papa en la región Andina de Colombia. Aplicaciones para el desarrollo de métodos de diagnóstico basados en RT-PCR.

Implementación de herramientas de secuenciación genómica de nueva generación (NGS) para el estudio de la roya del frijol (Uromyces appendiculatus) en cultivos de Antioquia

Desarrollo de métodos de detección serológica y molecular del complejo de virus asociado al Mosaico del tomate de árbol en Colombia

Bases para la implementación de prácticas de exclusión de Spongospora subterranea y el virus asociado Mop-top (PMTV) en cultivos de papa mediante el desarrollo de herramientas de diagnóstico in situ y en laboratorio

Determinación del virioma de ARN de Solanum tuberosum variedad Diacol Capiro utilizando secuenciación de nueva generación (NGS)

Detección de virus en tubérculo-semilla de papa mediante RT-PCR en tiempo real (qRT-PCR)

Sequencing of RNA viruses infecting an indigenous potato (Solanum phureja) to support future seed certification programs in Colombia

Sequencing of RNA viruses infecting an indigenous potato (Solanum phureja) to support future seed certification programs in Colombia

PUCCINIALES (ROYAS, FUNGI) EN PÁRAMOS DE ANTIOQUIA, COLOMBIA

Caracterización del Viroma de Frutales de la Familia Solanaceae en Colombia Utilizando Métodos de Secuenciación de Nueva Generación para el Desarrollo de Pruebas Diagnóstico

Desarrollo de una plataforma bioinformática para la detección y el estudio del procesamiento postraduccional de Potyvirus

• CARACTERIZACIÓN DEL POTYVIRUS ASOCIADO A LA VIROSIS DEL TOMATE DE ÁRBOL EN ANTIOQUIA (DIRECCIÓN DE TESIS)
• GENERACIÓN DE ANTÍGENOS DERIVADOS DE LA PROTEÍNA DE LA CÁPSIDE DE PVY, TALMV Y PMTV, PARA LA PRODUCCIÓN DE ANTICUERPOS ÚTILES EN EL DESARROLLO DE PRUEBAS SEROLÓGICAS. (DIRECCIÓN DE TESIS)
• Principios de virología molecular de plantas tropicales (Libro de autor que presente resultados de la investigación)
• Purificación de proteínas virales de Potyvirus mediante precipitación selectiva con Sulfato de amonio (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• DESARROLLO DE UNA PRUEBA DE RT-PCR MÚLTIPLE PARA LA DETECCIÓN DE LOS POTYVIRUS PVY Y TALMV EN SOLANÁCEAS (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• IDENTIFICATION OF A POTYVIRUS IN TREE TOMATO (SOLANUM BETACEUM) IN A COLOMBIAN REGION (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• MODELACION ESTRUCTURAL DE LA PROTEINA DE LA CAPSIDE DE UN POTYVIRUS. (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• DESARROLLO DE PRUEBAS DE DIAGNÓSTICO SEROLÓGICO PARA LA DETECCIÓN DEL VIRUS TALMV EN CULTIVOS DE TOMATE DE ÁRBOL (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• Modelación estructural de la proteína de la cápside del PLRV (Polerovirus) a partir de secuencias de variantes que afectan el cultivo del tomate de árbol (Solanum betaceum) en Colombia (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• DEVELOPMENT OF A PLATFORM FOR PLANT VIRUS DIAGNOSTICS AND CHARACTERIZATION USING NEXT GENERATION SEQUENCING (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• CARACTERIZACIÓN DE UNA NUEVA ESPECIE DE POTYVIRUS INFECTANDO CULTIVOS DE TOMATE DE ARBOL EN ANTIOQUIA (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• IDENTIFICACIÓN GENOTÍPICA DE VARIANTES DE LOS POTYVIRUS PVY Y TALMV EN COLOMBIA (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• COMPLETE GENOME SEQUENCE OF A PASSION FRUIT YELLOW MOSAIC VIRUS (PFYMV) ISOLATE INFECTING PURPLE PASSION FRUIT (PASSIFLORA EDULIS F. EDULIS) (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• MOLECULAR CHARACTERIZATION OF SOYBEAN MOSAIC VIRUS (SMV) INFECTING PURPLE PASSION FRUIT (PASSIFLORA EDULIS F. EDULIS) IN ANTIOQUIA, COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• MOLECULAR CHARACTERIZATION OF POTATO VIRUS Y (PVY) AND POTATO VIRUS V (PVV) ISOLATES NATURALLY INFECTING CAPE GOOSEBERRY (PHYSALIS PERUVIANA) IN ANTIOQUIA, COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• CHARACTERIZATION OF THE GENOME OF A NOVEL ILARVIRUS NATURALLY INFECTING CAPE GOOSEBERRY (PHYSALIS PERUVIANA) (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DEL GENOMA COMPLETO DE TRES VIRUS EN CULTIVOS DE LULO (SOLANUM QUITOENSE) DE ANTIOQUIA (COLOMBIA) (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• GENOME COMPARISON AND PRIMER DESIGN FOR DETECTION OF TAMARILLO LEAF MALFORMATION VIRUS (TALMV) (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• DETECTION AND SEQUENCING OF POTATO VIRUS Y (PVY) AND POTATO LEAFROLL VIRUS (PLRV) IN A VOLUNTEER PLANT OF SOLANUM TUBEROSUM L. CV. DIACOL-CAPIRO (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• GENOME SEQUENCING OF TWO BELL PEPPER ENDORNAVIRUS (BPEV) VARIANTS INFECTING CAPSICUM ANNUUM IN COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• SECUENCIACIÓN DEL GENOMA COMPLETO DEL POTATO YELLOW VEIN VIRUS (PYVV) EN TOMATE (SOLANUM LYCOPERSICUM) EN COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• DIAGNÓSTICO SEROLÓGICO Y MOLECULAR DEL POTATO LEAFROLL VIRUS (PLRV) EN TUBÉRCULOS-SEMILLA DE PAPA EN ANTIOQUIA, COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• GENOME CHARACTERIZATION OF A POTATO VIRUS S (PVS) VARIANT FROM TUBER SPROUTS OF SOLANUM PHUREJA JUZ. ET BUK. (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• DETECTION AND GENOME CHARACTERIZATION OF POTATO VIRUS Y ISOLATES INFECTING POTATO (SOLANUM TUBEROSUM L.) IN LA UNION (ANTIOQUIA, COLOMBIA) (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• GENOME SEQUENCE OF A DIVERGENT COLOMBIAN ISOLATE OF POTATO VIRUS V (PVV) INFECTING SOLANUM PHUREJA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• ANÁLISIS FILOGENÉTICO Y VARIABILIDAD MOLECULAR DEL POTATO VIRUS X (PVX) EN CULTIVOS DE PAPA DE ANTIOQUIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• UREDINALES (RUST FUNGI) BIOTA OF THE PARQUE NACIONAL DO ITATIAIA, BRAZIL: AN ANALYSIS OF COMPOSITION, SPECIES DIVERSITY AND ALTITUDINAL DISTRIBUTION (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• TWO NEW RUST SPECIES ON FABACEAE FROM BRAZIL (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• PURIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE UN ALFA AMILASA PRODUCIDA POR LA CEPA NATIVA BACILLUS SPP BBM1 (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• OBTENCIÓN DE ANTICUERPOS ESPECÍFICOS PARA LA DETECCIÓN DEL TAMARILLO LEAF MALFORMATION VIRUS (TALMV) EN TOMATE DE ÁRBOL (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• COMPLETE GENOME SEQUENCE OF AN ISOLATE OF POTATO VIRUS X (PVX) INFECTING CAPE GOOSEBERRY (PHYSALIS PERUVIANA) IN COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• COMPLETE GENOME SEQUENCE OF A NOVEL POTATO VIRUS S STRAIN INFECTING SOLANUM PHUREJA IN COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• ANALYSIS OF CARBOHYDRATE METABOLISM GENES OF SPONGOSPORA SUBTERRANEA USING 454 PYROSEQUENCING (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• MODELACIÓN ESTRUCTURAL DE LA PROTEÍNA DE LA CÁPSIDE DEL VIRUS A DE LA PAPA (PVA, POTYVIRUS) (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• CARACTERIZACIÓN SEROLÓGICA Y MOLECULAR DE POTYVIRUS ASOCIADOS A LA VIROSIS DEL TOMATE DE ARBOL EN ANTIOQUIA (COLOMBIA) (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• DETECCIÓN SEROLÓGICA Y MOLECULAR DEL POTATO VIRUS X (PVX) EN TUBÉRCULOS-SEMILLA DE PAPA (SOLANUM TUBEROSUM L. Y SOLANUM PHUREJA JUZ. & BUKASOV) EN ANTIOQUIA, COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• INCIDENCIA DE POTYVIRUS Y CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE PVY EN REGIONES PRODUCTORAS DE PAPA (SOLANUM TUBEROSUM L.) DE COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)