El grupo de investigación de agrobiodiversidad y biotecnología tiene como finalidad explorar la diversidad de las plantas y sus microorganismos asociados ya sean benéficos o patógenos para responder a problemas del ecosistema agrícola (suelo, planta, cultivo) mediante herramientas biotecnológicas. Se estudia la diversidad genética de los organismos y la expresión de sus genes para identificar y seleccionar los fenotipos de mayor interés agronómico. Para ello, el grupo se basa en tres líneas de investigación, la primera corresponde al estudio de la diversidad genética y su relación con el fenotipo en donde el análisis se realiza a nivel de secuencias nucleóticas (ADN y ARN) y peptídicas (proteínas). La segunda línea se enfoca en la bioprospección de esos recursos genéticos para conocer el potencial que tienen las bacterias, hongos y plantas en la resolución de problemas agrícolas y la tercera línea corresponde al desarrollo e innovación de un producto biotecnológico. El grupo esta conformado por investigadores pertenecientes a diferentes campos de investigación con la finalidad de contribuir en la solución de problemas al área agrícola de manera integral.

• BIOPROSPECCIÓN DE LOS RECURSOS GENÉTICOS
• DESARROLLO E INNOVACIÓN DE UN PRODUCTO BIOTECNOLÓGICO
• ESTUDIOS DE DIVERSIDAD GENÉTICA Y SU RELACIÓN CON EL FENOTIPO

El grupo hace parte del Centro de Excelencia en Genómica y Bioinformática de Ambientes Extremos, GeBiX, que busca la caracterización de los microorganismos asociados a diferentes ecosistemas del Parque Nacional Natural de Los Nevados, incluyendo el ecosistema Páramo en donde se encuentra el cultivo de papa. Por otro lado, tan bien ha liderado proyectos en cultivos de perennes (palma y cacao), frutales (uchuva, bananito, aguacate), leguminosas (frijol) papa. En particular ha estudiado la diversidad funcional de los microorganismos asociados a cultivos de interés agrícola y del eso de hongos nativos en la degradación de materia orgánica y del control de hongos fitopatógenos a nivel de cosecha y de poscosecha.

Explorar la biodiversidad de plantas y microorganismos para resolver problemas en la agricultura.

Integrar diferentes disciplinas con la finalidad de buscar respuestas integrales a los problemas del agroecosistema agrícola con participación internacional.

Centro de Excelencia en sistemas agrícolas, variabilidad y cambio climático

Centro de Excelencia en Genómica y Bioinformática de la Universidad Nacional de Colombia - CEGBio

Transcriptómica en papa criolla bajo estrés por alta temperatura

Biosistemas Agrobiodiversos

Caracterización de los microorganismos cultivables degradadores de celulosa, fijadores de nitrógeno y solubilizadores de fosfato presentes en suelos cacaoteros de los municipios de Yacopi-Nilo, Cundimarca, como contribución al manejo de la fertilidad del cultivo

Análisis de la expresion diferencial del genes mediante RNA-Seq

Determinación de la capacidad celulolítica de consorcios de hongos filamentosos en sustratos agroindustriales de interés comercial

Conformacion de una plataforma en metagenomica para la caracterizacion y el aprovechamientode recursos geneticos de ambientes extremos GeBix"

• Optimization of the production, purification and characterization of a laccase from the native fungus Xylaria (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Spatial regression modeling of soils with high cadmium content in a cocoa producing area of Central Colombia (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Alternativas ante el conflicto entre autoridades ambientales y habitantes de áreas protegidas en páramos colombianos” (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Evaluación de diferentes métodos de extracción de ARN a partir del hongo nativo Xylaria sp (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Effect of nitrogen and potassium fertilization on the production and quality of oil in Jatropha curcas L. under the dry and warm climate conditions of Colombia. (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Soil microbiome structural and functional characterization (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• ORIGIN AND EVOLUTION OF BIODIVERSITY (CAPÍTULO DE LIBRO)
• ABSORCIÓN DE MACRONUTRIENTES POR JATROPHA CURCAS L. PARA LA PRODUCCIÓN DE BIODISEL EN UN INCEPTISOL DE COLOMBIA (CODIRECCIÓN DE TESIS)
• ESTUDIO DE LA RESPUESTA DE DEFENSA DE LA ESPECIE THEOBROMA CACAO L. A LA INFECCIÓN DE PHYTOPHTHORA PALMIVORA (BUTLER). (CODIRECCIÓN DE TESIS)
• Chapter 3: Química de la solución del suelo (Capítulo en libro que presente resultados de la investigación)
• Chapter 7: Aspectos relacionados con la calidad de los análisis de suelo y de tejido vegetal, y su uso en las recomendaciones de manejo de la fertilización de cultivos. (Capítulo en libro que presente resultados de la investigación)
• COMPORTAMIENTO DE MICRONUTRIENTES EN UN SISTEMA DE PRODUCCIÓN DE CLAVEL EN SUSTRATO CON RECIRCULACIÓN DE DRENAJES (DIRECCIÓN DE TESIS)
• DETERMINACIÓN DE LA CAPACIDAD CELULOLÍTICA IN VITRO DE CONSORCIOS DE HONGOS PROVENIENTES DE SUELO DEL BOSQUE ALTO ANDINO Y TUSAS DE PALMA DE ACEITE (ELEAEIS GUINENSIS JACQ) EN DESCOMPOSICIÓN SOBRE DOS SUSTRATOS: TUSA Y CELULOSA MICROCRISTALINA (DIRECCIÓN DE TESIS)
• OPTIMIZACIÓN DEL PROCESO DE PRODUCCIÓN, PURIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE UNA LACASA A PARTIR DE UN HONGO NATIVO CON POTENCIAL APLICACIÓN EN PROCESOS BIOTECNOLÓGICOS. (DIRECCIÓN DE TESIS)
• DINÁMICA DEL CADMIO EN SUELOS CON NIVELES ALTOS DEL ELEMENTO, EN ZONAS PRODUCTORAS DE CACAO DE NILO Y YACOPÍ, CUNDINAMARCA (DIRECCIÓN DE TESIS)
• CARACTERIZACIÓN QUÍMICA DE MEZCLAS DE MATERIALES ORGÁNICOS Y MINERALES CON USO POTENCIAL EN CULTIVOS SIN SUELO. (DIRECCIÓN DE TESIS)
• CARACTERIZACIÓN DE COMUNIDADES MICROBIANAS ASOCIADAS A PRÁCTICAS AGRÍCOLAS Y USOS DEL SUELO DE LA VEREDA EL BOSQUE - PARQUE NACIONAL NATURAL DE LOS NEVADOS (DIRECCIÓN DE TESIS)
• EFECTO DEL 1-METILCICLOPROPENO (1-MCP) EN EL COMPORTAMIENTO POSCOSECHA DE BANANO BOCADILLO (MUSA ACUMINATA AA, SIMMONDS). (DIRECCIÓN DE TESIS)
• ENSAMBLAJE DE NOVO DEL GENOMA DE MONASCUS PURPUREUS 1596 Y ANOTACIÓN ESTRUCTURAL DE LOS GENES QUE CODIFICAN PARA POLICÉTIDO SINTASAS (PKSS) (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• DETERMINACIÓN DE LA ACTIVIDAD CELULOLÍTICA DE MICROORGANISMOS AISLADOS DE UN PERFIL DE SUELO DE BOSQUE ALTOANDINO DEL PARQUE NATURAL DE LOS NEVADOS, COLOMBIA (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• EVALUACIÓN IN VITRO DE LA ACTIVIDAD ANTI FÚNGICA DE CUATRO HONGOS LIGNOCELULOLÍTICOS SOBRE AISLADOS DE ALGUNOS HONGOS FITOPATÓGENOS DE INTERÉS AGRÍCOLA (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• OPTIMIZACIÓN DEL MÉTODO DE EXTRACCIÓN DE RNA A PARTIR DEL HONGO XYLARIA SP. Y DISEÑO DE PRIMERS PARA AMPLIFICAR EL GEN DE LA ¿-TUBILINA (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• CARACTERIZACIÓN DE LA COMUNIDAD MICROBIANA CULTIVABLE PRESENTE EN SUELOS CACAOTEROS EN EL MUNICIPIO DE NILO, CUNDINAMARCA, COMO CONTRIBUCION AL MANEJO DE LA FERTILIDAD DEL SUELO (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• CARACTERIZACIÓN DE MICROORGANISMOS CON POTENCIAL PARA DEGRADAR CELULOSA, FIJAR NITRÓGENO Y SOLUBILIZAR FÓSFORO EN UN SUELO CACAOTERO DEL MUNICIPIO DE YACOPÍ (CUNDINAMARCA) COMO APORTE AL MANEJO DE LA FERTILIZACIÓN DEL SUELO (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• CARACTERIZACION DE LA ACTIVIDAD LACASA BAJO CONDICIONES DE FERMENTACIÓN LÍQUIDA Y EXTRACCIÓN DE RNA DEL HONGO XYLARIA SP. (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• CARACTERIZACIÓN Y EVALUACIÓN CUALITATIVA DE LA ACTIVIDAD LIGNOCELULOLÍTICA DE HONGOS FILAMENTOSOS PROVENIENTES DE BOSQUE ALTO ANDINO Y DE TUSAS DE PALMA DE ACEITE (ELEAEIS GUINEENSIS JACQ.) EN DESCOMPOSICIÓN (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• MICROORGANISMOS ASOCIADOS AL NITRÓGENO EN SUELOS BAJO PAPA, GANADERÍA Y PÁRAMO, PARQUE LOS NEVADOS (DIRECCIÓN DE TRABAJOS DE GRADO)
• Workshop: Differential Gene Expression Analysis Using RNA-Seq (Organización de evento científico o tecnológico (congreso, feria, etc.))
• MICROORGANISMOS ASOCIADOS AL NITRÓGENO EN SUELOS BAJO PAPA, GANADERÍA Y PÁRAMO, PARQUE LOS NEVADOS (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• EXPLORATION FOR FUNGI WITH NOVEL LIGNOCELLULOLYTIC ENZYMES FROM TWO COLOMBIAN ECOSYSTEMS (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• IMPACTO DEL CULTIVO DE PAPA Y LA GANADERIA SOBRE GRUPOS FUNCIONALES DE MICROORGANISMOS DEL SUELO EN EL PARQUE NACIONAL NATURAL DE LOS NEVADOS, COLOMBIA (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• HABITANTES DE PÁRAMOS EN COLOMBIA Y ALTERNATIVAS DE CONSERVACIÓN: UN ANÁLISIS DESDE LA AGROECOLOGÍA. (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• ALTERNATIVAS ANTE EL CONFLICTO ENTRE AUTORIDADES AMBIENTALES Y HABITANTES DE ÁREAS PROTEGIDAS EN PÁRAMOS COLOMBIANOS (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• MICROBIAL COMMUNITIES IN THE SOILS HIGH ANDES FOREST OF COLOMBIA ANDEAN ECOSYSTEMS: WHO IS THERE AND WHY SHOULD WE CARE (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• OPTIMIZACIÓN DE LA PRODUCCIÓN DE LACASAS A PARTIR DE UN HONGO ASCOMICETO NATIVO MEDIANTE LA EVALUACIÓN DE DIFERENTES FUENTES DE CARBONO Y NITRÓGENO E INDUCTORES, Y LA APLICACIÓN DE UN DISEÑO ORTOGONAL (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• TAMIZAJES PARA CELULASAS A PARTIR DE LIBRERÍAS METAGENÓMICAS Y MICROORGANISMOS CULTIVABLES AISLADOS DE SUELOS (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• OPTIMIZACIÓN DE LA PRODUCCIÓN DE LACASAS A PARTIR DE UN HONGO ASCOMICETO NATIVO MEDIANTE LA EVALUACIÓN DE DIFERENTES FUENTES DE CARBONO Y NITRÓGENO E INDUCTORES, Y LA APLICACIÓN DE UN DISEÑO ORTOGONAL (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• PROGRAMA INTER-FACULTADES DE DOCTORADO EN BIOTECNOLOGÍA DE LA UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• CARACTERIZACIÓN DE MICROORGANISMOS CULTIVABLES INVOLUCRADOS EN LA FERTILIDAD DE SUELOS CACAOTEROS, CUNDINAMARCA, COLOMBIA (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• CARACTERIZACIÓN DE MICROORGANISMOS CULTIVABLES ASOCIADOS A CADMIO (CD) PRESENTES EN SUELOS CACAOTEROS EN CUNDINAMARCA-COLOMBIA (PONENCIAS EN EVENTOS ESPECIALIZADOS)
• HYDROLYSIS OF CELLULOSE AND OIL PALM EMPTY FRUIT BUNCHES BY USING CONSORTIA OF FUNGI ISOLATED FROM THE SOIL OF COLOMBIAN HIGH ANDEAN FOREST (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• AGRICULTURA Y VIDA EN EL PÁRAMO: UNA MIRADA DESDE LA VEREDA EL BOSQUE (PARQUE NACIONAL NATURAL DE LOS NEVADOS) (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• VARIATIONS IN GENOMIC DNA METHYLATION DURING THE LONG-TERM IN VITRO PROLIFERATION OF OIL PALM EMBRYOGENIC SUSPENSION CULTURES (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• ASSESSMENT OF CELLULOLYTIC MICROORGANISMS IN SOILS OF NEVADOS PARK, COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
• BIODIVERSIDAD DE GRUPOS FUNCIONALES DE MICROORGANISMOS EN EL PARQUE NACIONAL NATURAL DE LOS NEVADOS, COLOMBIA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA NO RECONOCIDA POR COLCIENCIAS)
• ALTERNATIVAS ANTE EL CONFLICTO ENTRE AUTORIDADES AMBIENTALES Y HABITANTES DE ÁREAS PROTEGIDAS EN PÁRAMOS COLOMBIANOS (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA NO RECONOCIDA POR COLCIENCIAS)
• Respuesta de Mentha spicata a la fertilización N-P-K combinada con compost: I. Producción de biomasa (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Respuesta de Mentha spicata a la fertilización N-P-K combinada con compost: II. Cambios en las propiedades químicas del suelo (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Potassium Availability in Smectitic Soils Under Plantations of Tropical Dry Forest In North Colombia (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Variables of Soil, Plant And Productivity Related With Age And Site Index In Gmelina Arborea Plantation In North Colombia (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Relationship between Cadmium levels in soil and beans in cacao production systems of the Colombian central Andean region. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Accumulation and translocation of cadmium in cacao production systems of the Colombian central Andean region. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Degradación de racimos de palma de aceite (Elaeis guineensis): un reto ambiental. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Purificación y caracterización de una lacasa extracelular del hongo ascomiceto nativo Xylaria sp. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Improving the cacao production technology in the provinces of Rionegro and high Magdalena, Cundinamarca-Colombia. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Evaluación de diferentes métodos de extracción de ARN a partir del hongo nativo Xylaria sp (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Antifungal evaluation of macro-fungi against some plant pathogenic fungi (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Ensamblaje de novo del genoma Monascus purpureus nrrl 1596 y anotacion estructural de los genes que codifican para policetido sintasas (PKSS). (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Estrategias de biorremediacion de suelos contaminados con cadmio (Cd). (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Role of the Universidad Nacional de Colombia in strengthening the cacao chain value in the country. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Evaluación in vitro del efecto de fungicidas comerciales sobre el aislamiento de M. roreri y en la actividad de potenciales controladores biológicos del patógeno. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Evaluación in vitro de lixiviados de cacao y aceites esenciales sobre M. roreri. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Identificación molecular y patogenicidad de Fusarium oxysporum en cultivos comerciales de tomate en Colombia. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Caracterización de microorganismos con potencial para degradar celulosa, fijar nitrógeno y solubilizar fosfatos en un suelo cacaotero del municipio de Yacopí (Cundinamarca) como aporte al manejo de la fertilización del suelo. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Alta concentración natural de cadmio en el suelo resulta en baja diversidad de hongos formadores de micorrizas arbusculares asociados a cacao (Theobroma cacao L.) (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Bacterias de suelo: una alternativa para la disminución de cadmio en plantas de cacao (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Respuesta antagónica de las vías de defensa durante la interacción Teobroma cacao y Phytophthora palmivora. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Evaluation in vitro of antifungal activity of four lignocellulityc fungi on indolated of some fungal pathogens of agricultural interest (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Exploration for fungi with novel lignocellulolytic enzymes in the high Andean Colombian forest (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Soil metagenomic: who is there and why we care?. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Caracterización de microorganismos cultivables tolerantes a Cadmio presente en suelos cacaoteros de Cundinamarca. Colombia (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Characterización of microbial community insolated from cocoa crop soils in a producer region in Colombia, as a contribution to soil fertility managment (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Effect of AMF native communities and rootstock genotypes on physiology of cocoa plants grown on Cd enriched Andean soil (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• EXPLORATION FOR FUNGI WITH NOVEL LIGNOCELLULOLYTIC ENZYMES IN COLOMBIA (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Zonas de transferencia de germoplasma como estrategia de conservación ante cambio climático. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Análisis Multicriterio para la Definición de Áreas de Conservación in situ de la Agrobiodiversidad. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Conservación y uso de razas nativas de maíz. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Aplicaciones y Herramientas de Ecogeografía para la Colecta, Conservación y Utilización de la Agrobiodiversidad. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Global Focused Identification of Germplasm Strategy (figs) application on Trifolium repens L. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Use of eco-geographic tools in planning an optimized collection of wild relatives of cultivated legumes and cereals in Spain. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Ecogeographical Land Characterization (ELC) maps as a tool for optimized collecting and improvement on representativeness of a Trichloris genebank in Argentina. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Predictive characterization of Beta CWR using the ecogeographical filtering method. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Facilitated spatial and ecogeographical germplasm analysis for efficient PGR conservation and utilization. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• New predictive characterization methods for accessing and using CWR diversity. (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Exploration of microbial soil communities in Andean ecosystem, who is ther and why (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Exploration for fungi with novel lignocellulolytic enzymes in Colombia (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Papel de los procesos demográficos y de la selección en la estructura genética de frijol Lima (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• in vitro evaluation of antifungal activity of four lignocellulolytic fungi against some agronomical relevant fungal phytopathogens (Presentación de ponencia en evento científico o tecnológico)
• Caracterización de la actividad lacasa bajo condiciones de fermentación líquida y extracción de RNA del Hongo Xylaria sp (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Identificación de una especie arvense desconocida y propuesta de manejo (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Determinación de la actividad lacasa del hongo de pudrición blanca pleurotus ostreatus cepa comercial sobre tres medios en fermentación sumergida (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Microorganismos cultivables asociados a cadmio (Cd) presentes en suelos cacaoteros de los municipios de Yacopí y Nilo, como estrategia de bioremediación (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Evaluación de la capacidad de la toma del cadmio de bacterias y hongos provenientes de suelos cacaoteros de los municipios de Nilo y Yacopí – Cundinamarca e identificación de genes asociados a su tolerancia. (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Identificación y evaluación de un hongo como posible controlador biológico del ácaro Tetranychus uticae Koch (Acari: Tetranychidae) bajo condiciones controladas (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Evaluación in vitro de lixiviados de cacao, extractos biológicos y microorganismos controladores sobre Moniliophora roreri (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Efectos de las comunidades locales de HFMA en la fisiología de plantas de cacao (Theobroma cacao L.) de los genotipos IMC-67 y PA-121 en Yacopí-Cundinamarca. (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Caracterización de las propiedades físicas, químicas y biológicas de suelo de paramo bajo diferentes usos de suelo (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Diagnóstico de los niveles de cadmio en el suelo y su distribución en hojas y frutos de cacao cultivado en Nilo y Yacopí, Cundinamarca (TDG (Trabajo dirigido de grado))
• Análisis preliminar de la diversidad genética de Moniliophthora roreri (Cif.) EVANS et al. agente causal de la moniliasis del cacao en Cundinamarca (TDG (Trabajo dirigido de grado))