Las colecciones de ornitología del Instituto de Ciencias Naturales constituyen la Colección Nacional de Aves, la cual es la más grande, histórica, representativa y completa para las aves silvestres en el país de las aves, Colombia. Actualmente la Colección Nacional de Aves resguarda alrededor de 43.000 especímenes p, que representan cerca de 1650 especies de aves colombianas. Contiene 194 especímenes tipo, incluyendo 45 holótipos, o tipos nomenclaturales. Las preparaciones que conservan incluyen piel de estudio, esqueletos, anatómicos en líquido, sangre, tejidos y recursos moleculares, alas abiertas, plumas, ectosimbiontes, nidos, nidadas completas y cáscaras de huevos. Además contamos con un importante archivo documental histórico de la colección que incluye correspondencia saliente y entrante, ilustraciones originales, fotografías, cintas de video y audio, y manuscritos. La Colección Nacional de Aves fue la primera colección zoológica del Instituto de Ciencias Naturales (entonces Instituto de Botánica) gracias al director Armando Dugand Gnecco, quien contrató los servicios del joven ornitólogo payanés Federico Carlos Lehmann. Entre los directores y curadores de la colección, que además han sido profesores, se incluyen (en orden cronológico): Federico Carlos Lehmann, José Ignacio Borrero, Antonio Olivares, Hernando Romero, Gonzalo Arango, F. Gary Stiles y Andrés M. Cuervo. La colección ha contado con asistentes curatoriales, ornitólogos colaboradores cercanos, como Jorge I. Hernández Camacho, Nicéforo María, José Vicente Rodríguez, Jorge Morales, Pablo Bernal, Arturo Rodríguez, Juan Pablo López, Diego Carantón, Natalia Pérez, Carlos Esteban Lara, Katherine Certuche, Elcira López, Jhon Ruiz, Laura Gamba, y un sinnúmero de egresados y estudiantes. Al ser una colección perteneciente a una universidad, numerosos estudiantes se han beneficiado de ella para sus investigaciones, al tiempo que han apoyado activamente su desarrollo, crecimiento y gestión. Este espacio, físico y biocultural, ha sido la escuela para la formación de otras colecciones a lo largo y ancho del país, como es el caso del INDERENA (actualmente Instituto Humboldt) y de otras universidades. La Colección Nacional de Aves ha contribuido sustancialmente al desarrollo de la ornitología, la apreciación y observación de aves, y la generación de políticas públicas de conservación. Ha sido la piedra angular, la colección de referencia de las aves colombianas. Esta colección realiza sus actividades bajo los lineamientos constitucionales y legales que la rigen, en particular por parte del Ministerio de Ambiente (Decretos 1375 y 1376 de 2013) y la ANLA. La Resolución 0255 del 12 de marzo de 2014 (2014-2024) y la Resolución 000697 del 18 de abril del 2024 (2024-2034) de la ANLA, otorgan a la Universidad Nacional de Colombia el permiso marco de recolección de especímenes silvestres.