Vouilloud, A. A., S. E. Sala, M. Núñez Avellaneda & S. R. Duque.:
2010. Diatoms from the Colombian and Peruvian Amazon: the genera Encyonema, Encyonopsis and Gomphonema. Revista de Biología Tropical 58(1): 45-62.

Alba-M., A., D. M. Jiménez-H., W. López & S. R. Duque .:
2011. Revisión de las algas planctónicas de la laguna de Fúquene (Boyacá, Colombia). Revista Inheringia - serie Botánica, Brasil 66(1): 147-156

Andrade-Sossa C. E., M. García-Folleco, C. A. Rodríguez-Munar, S. R. Duque & E. Realpe:
2011. Efectos de la fluctuación del nivel del agua sobre la estructura del ensamblaje de rotíferos en el lago Largo (Sistema Yahuarcaca - Llanura de inundación del río Amazonas - Colombia). Caldasia 33(2): 499-517.

Guisande C., P. Pelayo-Villamil, M. Vera, A. Manjarrés-Hernández, M. R. Carvalho, R. P. Vari, L. F. Jiménez, C. Fernández, P. Martínez, E. Prieto-Piraquive, C. Granado Lorencio & S. R. Duque.:
2012. Ecological factors and diversification among Neotropical characiforms. International Journal of Ecology. doi:10.1155/2012/610419

Tolivia, A. A., M. Núñez-Avellaneda, S. R. Duque & V. Conforti:
2012. A Taxonomic and Ultrastructural Study of naked Euglenophyta from Colombia. Algological Studies 140:3-21

Salcedo-Hernández M. J., S. R. Duque, L. Palma, A. Torres-Bejarano, D. Montenegro, N. Bahamón, L. Lagos, L. F. Alvarado, M. Gómez & A. P. Alba.:
2012. Ecología del fitoplancton y dinámica hidrológica del sistema lagunar de Yahuarcaca, Amazonas, Colombia: análisis integrado de 16 años de estudio. Mundo Amazónico 3:17-42

Hernández-Altilano E., N. J. Aguirre-Ramírez, J. A. Palacio-Baena, J. J. Ramírez-Restrepo, Santiago R. Duque, C. Guisande, N. Aranguren & M. Mogollón.:
2012. Rasgos morfológicos del fitoplancton en seis ambientes leníticos de las regiones Amazónica, Andina y Caribe de Colombia. Actualidades Biológicas 34(96):67-83.

García-Folleco M., C. Guisande, A. Acuña, A. Barreiro & S. R. Duque:
2013. Competition for inorganic nutrients among five species of Amazonian phytoplankton in bath culture: both nitrate and phosphorus account. Current Topics in Plant Biology 13:95-102

Torres-Bejarano A. M., S. R. Duque & P. Caraballo-Gracia:
2013. Heterogeneidad temporal y espacial de dos lagos de inundación en la Amazonia colombiana. Actualidades Biológicas 35(98): 63-76

Echenique R. O., M. Núñez-Avellaneda & S. R. Duque:
2013. Chlorococcales de la Amazonia colombiana. II. Boletín Sociedad Argentina de Botánica. 48 (3-4): 407-420

Vouilloud, A., Sala, S. E., Núñez-Avellaneda, M., Montoya Moreno, Y. & Duque S. R.:
2013. Diatoms from Colombian lowland waters: the Genus Brachysira (Naviculales, Bacillariophyceae. Diatom Research. http://dx.doi.org/10.1080/0269249X.2013.866909

Cardozo A Y., D. Ferreira, E. Mendes da Silva, S. R. Duque Escobar, J. O. Rangel-Churio, A. Sifeddinef & B. Turcq & A. L. Spadano Albuquerque:
2014. Holocene paleolimnological reconstruction of a high altitude Colombian tropical lake. Palaeogeography, Palaeoclimatology & Palaeoecology. 415 (1):127-136

Torres-Bejarano M. A., S. R. Duque & P. Caraballo:
2014. Papel trófico del zooplancton a través del análisis de isótopos estables en un lago de inundación en la Amazonia colombiana. Caldasia 36(2):331-344

Díaz-Olarte J. J. & S. R. Duque:
2009. Ensambles algales en un ecosistema natural de la planta carnívora tropical Utricularia foliosa L. Caldasia 31(2): 307-325

Arias-B. M. J., J. Ch. Donato-Rondón & S. R. Duque:
2022. Assessment and perceptions of the environmental quality of the urban and suburban wetlands of Leticia (Amazonas, Colombia). Wetland Science and Practice - Latin America 40(1):66-77.

Hernández E., N, Aguirre, K. Palacio, J. Palacio, J. J. Ramírez, S. R. Duque, M. Mogollón & C. Kruk:
2020. Clasificación de grupos morfofuncionales del fitoplancton en seis sistemas lénticos de las regiones Caribe, Andina y Amazónica de Colombia. Rev. Acad. Colomb. Cienc. Ex. Fis. Nat. 44(171): 392-406

Ricaurte L F., J. E. Patiño, D. F. Restrepo-Zambrano, J. C. Arias-G., O. Acevedo, C. Aponte, R. Medina, M. González, S. Rojas, C. Flórez, L. Estupiñán-Suárez, Ú. Jaramillo, A. Carolina Santos1, C. A. Lasso, A. A. Duque-Nivia, S. Restrepo, J. I. Vélez, J. H. Caballero-Acosta, S. R. Duque, M. Núñez-Avellaneda, I. D. Correa, J. A. Rodríguez-Rodríguez, S. P. Vilardy Q., A- Prieto-C., A. Rudas-Ll., A. M. Cleef, M. Finlayson & W. J. Junk:
2019. Classification System of Colombian Wetlands: an essential step forward in open environmental policy-making. Wetlands. 39(147):1-20.

Andramunio-Acero CP., P. R. Caraballo-Gracia, S. R. Duque & L. C. Solari:
2018. Cambios en la estructura de la comunidad perifítica en el sistema de lagos de Yahuarcaca, Amazonía colombiana. Actualidades Biológicas 41(109):1-57

Manjarrés-Hernández A. M., C. Guisande, E. García-Rosello, P. Pelayo-Villamil, J. González-Dacosta, J. Heine, L. González, C. Granado-Lorencio, S. R. Duque & J. M Lobo:
2018. A procedure to assess the spatial variability in the importance of abiotic factors affecting distributions: the case of world freshwater fishes. Current Zoology 64(5): 549-557.

Aranguren-Riaño NJ., C. Guisande, J. Shurin, N. T. Jones, A. Barreiro & S. R. Duque:
2018. Amino acid composition reveals functional diversity of zooplankton in Colombian lakes related to geography, taxonomy and productivity. Oecologia 187: 719-730

Muñoz-López C. L., N. J. Aranguren-Riaño & S. R. Duque:
2017. Morfología funcional del fitoplancton del lago de Tota (Boyacá-Colombia). Revista de Biología Tropical 65(2): 669-683

Manjarrés-Hernández AM., C. Guisande, E. García-Roselló, P. Pelayo-Villamil, J. González-Dacosta, J. Heine, L. González Vilas, C. Granado-Lorencio, SR. Duque & JM. Lobo.:
2017. Assessing the spatial variability in the importance of the abiotic factors affecting the distribution of freshwater fish species. Current Zoology 1-9.

Gómez M., Rivera R., Duque S. R., Andrade C. & Rodríguez C.:
Análisis temporal y espacial del fitoplancton en el sistema de lagos de Yahuarcaca, planicie de inundación del río Amazonas (Leticia - Colombia). Astrolabio 10 (1): 10-26

Figueroa I. C., A. Fachín-Terán & S. R. Duque.:
2012. Componentes alimenticios de las tortugas Podocnemis unifilis y P. expansa (Testudines: Podocnemididade) en el resguardo Curare-Los Ingleses, Amazonas, Colombia. Nota corta. Rev. Colombiana cienc. Anim. 4(2):441-453

León J. G., F. Guerín, Martín-M D. C. & S. R. Duque:
2012. Cuantificación de gases de efecto invernadero en zonas húmedas tropicales: El caso Yahuarcaca, amazonia colombiana. Acta Agronómica - Número especial 1-2.

Hernández-Altilano E., N. Aguirre, J. Palacio, J. J. Ramírez, S. R. Duque, C. Guisande, N. Aranguren & M. Mogollón:
2013. Evaluación comparativa de algunas características limnológicas de seis ambientes leníticos de Colombia. Rev. Fac. Ing. Univ. Antioquia 69: 216-228

Santos Angarita A., E. Cassú Camps, M. Pérez Rúa & S. R. Duque:
2013. Memoria ambiental de los tikuna en los lagos de Yahuarcaca (Amazonia colombiana). Colombia Amazónica (Instituto Sinchi) 6: 41-67

Palma L., M. Núñez-Avellaneda & S. R. Duque.:
2014. Efecto de la conectividad del río Amazonas sobre la física y química de las aguas en ambientes de la planicie aluvial de Colombia. Colombia Amazónica 7:129-148

Duque S. R.:
2011. Amazonia: Un mundo de agua y complejas relaciones. Pg: 160-169. En Echeverri & Pérez (eds.) Amazonia colombiana: Imaginarios y realidades. Memorias Cátedra Jorge Eliecer Gaitán. Vicerrectoría de Investigación, Universidad Nacional de Colombia. Bogotá.

Duque S. R., Torres, N. N., Arteaga, F., Fajardo, D., Coral, A., & Vallejo, M.:
2012. Macroinvertebrados acuáticos asociados a las Microcuencas (pp. 91-108). En Fajardo, D., LG. Naranjo, & I. Niño (Eds.) Manejo integral de cuencas hidrográficas a través del uso de agroforestería sustentable en la Amazonia colombiana Cali, Colombia. Corpoamazonia y WWF Colombia

Duque S. R., L. J. Marciales- Caro, D. Castro-Roa, M. G. Cano, M. J. Calderón-Chérrez & R. O. Echenique:
2013. Las algas desmidiáceas como indicadoras: Mateyuca y Flor Amarilla, dos morichales testigo de la biodiversidad del Orinoco. Páginas 153 - 163. En Lasso et al (eds.). Morichales y Cananguchales de la Orinoquia y Amazonia: Colombia y Venezuela. Serie Recursos Hidrobiológicos y Pesqueros Continentales de Colombia VII. Instituto de Investigación de los Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH). Bogotá, D. C., Colombia.

Trujillo F. y S. R. Duque (editores):
2014. Los humedales de Tarapoto: aportes al conocimiento sobre su biodiversidad y uso. Serie humedales de la Amazonia y Orinoquia. Fundación Omacha, Corpoamazonia, Universidad Nacional Sede Leticia. 400 páginas

Duque S. R. & C. A. Lasso:
2014. Biota acuática: generalidades. 97-102. En Lasso et al (eds.). Humedales interiores de Colombia: Identificación, caracterización y establecimiento de límites según criterios biológicos y ecológicos. Serie Recursos Hidrobiológicos y Pesqueros Continentales de Colombia X. Instituto Humboldt, Bogotá

Duque S. R, Dulcey C. L., Acero J. S., Pulido O. L., Restrepo D., Jiménez E. M., Pérez C., Duque F., Suarez M., Van Vliet K., Urrego Y., Concha C., Duque J. D., & Vargas L. Y.:
2018. Acotamiento de la ronda hídrica del río Mulato en la zona urbana del municipio de Mocoa, departamento del Putumayo. Convenio 588 de 2016 entre UN Sede Amazonia & Corpoamazonia. Leticia. 368p. https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/78621

Duque S. R, Dulcey C. L., Acero J. S., Pulido O. L., Restrepo D., Jiménez E. M., Pérez C., Duque F., Suarez M., Van Vliet K., Urrego Y., Concha C., Duque J. D., & Vargas L. Y.:
2018. Acotamiento de la ronda hídrica del río El Hacha en la zona urbana del municipio de Florencia, departamentos del Caquetá. Convenio 588 de 2016 entre UN Sede Amazonia & Corpoamazonia. Leticia. 363p. https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/78617

Duque S. R, Dulcey C. L., Acero J. S., Pulido O. L., Restrepo D., Jiménez E. M., Pérez C., Duque F., Suarez M., Van Vliet K., Urrego Y., Concha C., Duque J. D., & Vargas L. Y.:
2018. Acotamiento de la ronda hídrica de la quebrada Yahuarcaca en la zona urbana del municipio Leticia, departamento del Amazonas. Convenio 588 de 2016 entre UN Sede Amazonia & Corpoamazonia. Leticia. 447p. https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/78622

Torres-Zambrano N., S. R. Duque & E. Domínguez:
2010. Asociación de macroinvertebrados y sus grupos alimentarios en la planta carnívora Utricularia foliosa - Lentibulariaceae (Quebrada Yahuarcaca-Amazonia colombiana). En: Duque & Tobón (eds.). Remando a varias manos. Investigaciones de la Amazonia Colombiana. Imani mundo IV: 241-271

Prieto-Piraquive E., O. Castillo, Á. Bolivar, B. Corrales, C. Granado-Lorencio & S. R. Duque:
2010. Composición, abundancia y biomasa de la ictiofauna de los lagos de Yahuarcaca (Amazonia Colombiana) durante un ciclo hidrológico. En: Duque & Tobón (eds.). Remando a varias manos. Investigaciones de la Amazonia Colombiana. Imani mundo IV: 227-240

Ríos-Villamizar E. A. & S. R. Duque:
2010. Calidad del agua y aspectos hidrológicos de la quebrada Yahuarcaca: especial énfasis en su función como fuente abastecedora para la ciudad de Leticia, sur de la Amazonia colombiana. En: Duque & Tobón (eds.). Remando a varias manos. Investigaciones de la Amazonia Colombiana. Imani mundo IV: 205-226

Fernández, Á., van Vliet, K., Pérez-Cubillos, C., Demetrio, C., & Duque, S. R.:
2017. La Vida de la Selva Inundable. Una guía de campo con conocimientos tradicionales y locales, para descubrir la flora y fauna de nuestros bosques, lagos y quebradas. Yahuarcaca y Tarapoto, en la Amazonia colombiana. (Á. Fernández et al Eds.). Leticia: Universidad Nacional de Colombia, Fundación GRUPO PROA y Stichting Mandioca. 166pp

Oliveros A. M.:
2016. El fitoperifiton como Bioindicador de calidad de agua, una herramienta y estrategia en la gestión ambiental del caño Quenane. Maestría en Gestión Ambiental Sostenible. Universidad de los Llanos, Villavicencio. Director

Torres-Bejarano A. M.:
2013. Ecología trófica y dinámica del ensamble de zooplancton en dos lagos de inundación de la Amazonia colombiana. Tesis MSc. Estudios Amazónicos, Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia. Codirector. Tesis meritoria.

Andramumio-Acero C. P.:
2013. Dinámica sucesional y ecología trófica de la comunidad perifítica en dos ambientes del sistema lagunar de Yahuarcaca (Amazonas, Colombia). Tesis MSc. Estudios Amazónicos. Sede Amazonia. Universidad Nacional de Colombia. Leticia. Codirector. Tesis Meritoria.

Cardona S. M.:
2011. Evaluación de la calidad de agua para consumo humano en un municipio de le región amazónica: caso de estudio Acueducto Barrios Unidos, Mocoa. Especialización en Estudios Amazónicos, convenio UN Amazonia & Corpoamazonia, Mocoa. Director.

Marciales-Caro L. J.:
2012. Diversidad de grupos funcionales basado en la morfología del fitoplancton en humedales de la Orinoquia Colombiana. Tesis MSc. Universidad de los Andes, Bogotá. Director.

Revelo R. E.:
2011. Evaluación técnica de la truchicultura en el Valle de Sibundoy, Departamento del Putumayo. Especialización en Estudios Amazónicos, convenio UN Amazonia & Corpoamazonia, Mocoa. Director.

Franco-Rojas H.:
2011. Evaluación de la densidad y alimentación en el desempeño reproductivo del pirarucú Arapaima gigas en cautiverio. Tesis MSc. Estudios Amazónicos, Universidad Nacional de Colombia & Universidad de la Amazonia. Florencia, Caquetá (Colombia). Codirector.

Celis-Granada M. S.:
2011. Estructura de la comunidad íctica en un arroyo del piedemonte amazónico (Florencia-Caquetá). Tesis MSc Estudios Amazónicos. Convenio Universidad Nacional de Colombia - Sede Amazonia & Universidad de la Amazonia. Florencia, Caquetá. Tesis meritoria. Director.

Manjarrés-Hernández A.:
2010. Identificación de especies del Orden Characiformes en dos cuencas colombianas (Amazonas y Magdalena) a través de una metodología estadística de clasificación. Tesis Msc. Estudios Amazónicos. Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia, Leticia. Tesis Meritoria. Codirector. https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/81013

Muñoz R.:
2009. Sistematización del estado del conocimiento de macroinvertebrados acuáticos como bioindicadores en sistemas lóticos de Sudamérica. Monografía Especialización en Estudios Amazónicos convenio Universidad Nacional de Colombia - Sede Amazonia & Universidad de la Amazonia. Florencia, Caquetá. Director.

Gómez M. C.:
2008. Dinámica espacial y temporal de la comunidad fitoplanctónica en el lago Yahuarcaca, Planicie de inundación del río Amazonas. Tesis MSc. Universidad Javeriana Bogotá. Codirector.

López-Casas S.:
2008. El pirarucú Arapaima gigas (Cuvier, 1817) (Pisces: Osteoglossidae) en los lagos del sistema de Tarapoto: aspectos demográficos y culturales. Tesis Maestría en Estudios Amazónicos, Imani Sede Amazonia UN. Tesis Meritoria. Codirector.

Camacho K.:
2005. La pesca del bagre pintadillo rayado Pseudoplatystoma fasciatum (Linnaeus, 1766), aspectos del conocimiento local, de la biología pesquera y parámetros poblacionales en el alto río Amazonas: sector de Leticia - Colombia. Tesis Maestría en Estudios Amazónicos. Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia, Leticia. Codirector.

Pantoja N:
2017. Estimación de caudales ecológicos mediante métodos hidrológicos, hidráulicos y ecológicos en la quebrada El Conejo (Mocoa-Putumayo). Maestría en Conservación y Uso de la Biodiversidad. Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá. Director.

García L.:
2017. Estudio de la desmidioflórula de cuatro cananguchales en la vía Leticia - Tarapacá para la determinación de su estado trófico. Tesis Universidad Javeriana Bogotá.

Turriago J. D.:
2014. Ecología funcional de raíces aéreas absorbentes del Yaré (Heteropsis spp. Kunt en bosques de Tierra Firme de la Amazonia colombiana. Tesis MSc. Estudios Amazónicos, Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia. Codirector.

Bermúdez A. L:
2013. Nidificación de Podocnemis sextuberculata (Cornalia, 1849; Testudines, Podocnemididae) en la Reserva Biológica del Río Trombetas, Pará - Brasil Tesis MSc. Estudios Amazónicos. Sede Amazonia. Universidad Nacional de Colombia. Leticia. Codirector.

Manjarrés-Hernández A. M.:
2021. Análisis de la distribución de las especies de peces de agua dulce a diferentes escalas espaciales y temporales. Tesis PhD Estudios Amazónicos UNAL-Sede Amazonia. Tesis laureada. Colaborador. https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/79990

Carrillo E.:
2013. Dispersión direccional de semillas por saltarines (Aves: Pipridae) en bosques de la Amazonia occidental, Leticia - Colombia. Tesis Msc Estudios Amazónicos. Sede Amazonia UN. Leticia. Codirector

Duarte J. J.:
2012. Ecología trófica de camarones (Crustácea, Palaemonidae) en la quebrada La Arenosa del sistema Yahuarcaca (Leticia, Amazonas)¿. Tesis MSc. Estudios Amazónicos, Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia. Codirector.

Tobón-Pérez J. F.:
2012. Cuantificación del Flujo de Carbono en el Arroyo de aguas negras La Arenosa (Leticia: Amazonas)¿. Tesis MSc. Estudios Amazónicos, Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia. Codirector.

Mogollón M. J.:
2012. Ecología funcional del fitoplancton de algunos cuerpos de agua del Caribe Colombiano. Maestría en Ciencias Ambientales. SUE-Caribe. Director.

Morales N. E.:
2011. ¿Qué es un bioindicador? aprendiendo a partir del ciclo de indagación guiada con macroinvertebrados bentónicos - propuesta metodológica. Tesis Msc. Enseñanza de las Ciencias, Facultad de Ciencias Sede Bogotá. Universidad Nacional de Colombia. Director.

Mejía L. A.:
2011. Modelo de gestión ambiental en obra de comunicación vial variante San Francisco - Mocoa. Especialización en Estudios Amazónicos, convenio UN Amazonia & Corpoamazonia, Mocoa. Director.

Chaves-Moreno L. C.:
2011. Distribución actitudinal y espacial de la familia Loricariidae en la región Andino-amazónica, cuenca del río Hacha (Florencia Caquetá). Tesis MSc. Estudios Amazónicos, Universidad Nacional de Colombia & Universidad de la Amazonia. Florencia, Caquetá (Colombia). Codirector.

Palma L. 2011.:
Efecto de la conectividad del río Amazonas en la ecología del fitoplancton en lagos amazónicos. Tesis MSc. Estudios Amazónicos. Imani, Sede Amazonia UN. Codirector.

Figueroa I. C.:
2010. Saber local, uso y manejo de las tortugas Charapa Podocnemis expansa y Taricaya Podocnemis unifilis en el resguardo Curare-Los Ingleses. La Pedrera: Amazonas - Colombia. Tesis Msc. Estudios Amazónicos. Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia, Leticia. Tesis meritoria. Codirector.

Ardila Solange L.:
2009. Dinámica de gramalotales en las llanuras inundables del río Amazonas- Puerto Nariño- Colombia. Tesis MSc. Estudios Amazónicos UN Amazonia. Leticia. Tesis meritoria. Director.

Serrato C.:
2008. Estado de calidad de Aguas del Sistema Andino-Amazónico Colombiano, a través de la bioindicación con macroinvertebrados acuáticos. Trabajo Monográfico Especialización en Estudios Amazónicos. Convenio Universidad Nacional de Colombia - Sede Amazonia y Universidad de la Amazonia. Florencia, Caquetá. Monografía meritoria. Director.

Torres N. N.:
2008. Estructura de los macroinvertebrados acuáticos presentes en la planta carnívora Utricularia foliosa, Quebrada Yahuarcaca (Amazonas, Colombia). Tesis Maestría en Estudios Amazónicos, Imani Sede Amazonia UN. Codirector.

Bolivar A.:
2006. Estudio de la comunidad de peces en dos quebradas de aguas negras amazónicas (Colombia): ecología y bases filogenéticas para su entendimiento. Tesis Maestría en Estudios Amazónicos. Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia. Leticia. Tesis Meritoria. Codirector

Currea A.:
2006. Degradación de hojarasca en un igarapé (Leticia - Amazonas, Colombia): la acción de grupos funcionales de insectos acuáticos. Tesis Maestría en Estudios Amazónicos, Sede Amazonia UN. Codirector.

Moreno P. A.:
2005. Identificación de las especies de peces ornamentales de interés comercial en la ciudad de Leticia - Amazonas. Tesis Especialización en Estudios Amazónicos UN, Amazonia. Director.

Castillo C. Y.:
2000. Biomasa y productividad primaria del fitoperifiton en dos lagos de inundación del río Amazonas en Colombia. Tesis MSc. Universidad Nacional de Colombia. Santafé de Bogotá. Director.

Ríos-Villamizar E.:
2005. Valoración del estado de la calidad de las aguas de la quebrada Yahuarcaca, con especial énfasis en áreas relacionadas con su función como fuente abastecedora de agua potable para la ciudad de Leticia. Tesis Especialización en Estudios Amazónicos UN, Amazonia. Director.

Ordóñez Y.:
2002. Estructura de la comunidad de algas epífitas en dos macrófitas Paspalum repens y Polygonum densiflorum en los lagos de Yahuarcaca, Amazonas - Colombia. Tesis MSc. Universidad de los Andes, Bogotá. Director.

Cruz L. A.::
2015. Determinación de metales pesados bioacumulables en especies ícticas de interés comercial de la cuenca alta del río Amazonas, Colombia. Tesis MSc. en Gestión del Agua. Universidad de Buenos Aires. Argentina. Nota Sobresaliente. Director

Cardona S.:
2021. Ecología de macroinvertebrados en arroyos de montaña, caso de estudio confluencia del río Sangoyaco y río Taruca, municipio de Mocoa, departamento del Putumayo. Tesis Maestría en Estudios Amazónicos, Mocoa. Director https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/79536

Henao E. C.:
2021. Reconstrucción paleoambiental del Holoceno tardío y evaluación de Ostracoda en el sistema de lagos Yahuarcaca, Amazonas-Colombia. Tesis PhD Universidad del Valle. Cali. Colaborador.

Acosta A.:
2020. Bioecología y pesquería local de rayas de agua dulce (Myliobatiformes; Potamotrygonidae) en el río Amazonas colombiano. Tesis Msc. Estudios Amazónicos. Sede Amazonia. Universidad Nacional de Colombia. Leticia. Codirector.

Cueva J. C.:
2018. Desarrollo de una metodología de priorización y diferenciación de proyectos de aprovisionamiento de agua para consumo humano en una zona rural colombiana. Msc. Medio Ambiente y Desarrollo. Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín. Beca CEIBAS Sistema General de Regalías del Depto. Amazonas. 151p. Asesor Regional.

Patarroyo J. J.:
2018. Aspectos reproductivos y poblacionales del sábalo Brycon amazonicus (Spix y Agassiz, 1829), en el sector colombiano del río Amazonas (Leticia). Tesis Msc. Estudios Amazónicos. UN Sede Amazonia. Meritoria. Codirector.

Duque SR:
1997. Tipificación limnológica de algunos lagos de la Amazonia colombiana a través de la composición, biomasa y productividad del fitoplancton. Tesis MSc UNAL.

Mejía A:
2018. Diseño de una estrategia de compensación por pérdida de biodiversidad para Corpoamazonia, Proyecto de desarrollo vial ¿Construcción variante San Francisco - Mocoa¿ a su paso por la Reserva Forestal Protectora de la cuenca alta del río Mocoa. Tesis Maestría en Estudios Amazónicos, Mocoa. Director.

Prieto-Piraquive E. F.:
2018. Ecología Trófica de un Lago de Varzea (Amazonas, Colombia). Tesis PhD Universidad de Murcia, España. 161p. Colaborador

Sanabria-Aranda L.:
2008. Influencia de las variables físicas y químicas en la abundancia y composición de copépodos, cladóceros y rotíferos presas de Utricularia foliosa. Tesis Universidad Industrial de Santander Bucaramanga. Asesor.

Valoyes-Valois L. V.:
2007. Composición perifítica de la planta acuática carnívora Utricularia foliosa presente en la quebrada y lagos Yahuarcaca Leticia- Amazonas, Colombia. Programa de Biología con Énfasis en Recursos Naturales, Universidad Tecnológica del Choco, Quibdó. Asesor Externo.

Torres A.:
2006. Ecología funcional del fitoplancton en el sistema de lagos Yahuarcaca (Leticia-Amazonas). Tesis Depto. Biología Universidad Pedagógica Nacional, Bogotá. Codirector.

Duarte J. J. & R. Capador.:
2006. Determinación de la entomofauna acuática asociada a las macrófitas más representativas del lago Yahuarcaca (Leticia, Amazonas). Tesis Depto. Biología Universidad Pedagógica Nacional. Bogotá. Codirector.

Andramunio C. P.:
2006. Estudio de la comunidad fitoperifítica asociada a sustratos naturales durante un período hidrológico en el lago Tarapoto (Amazonia colombiana). Tesis Depto. Biología Universidad Pedagógica Nacional. Bogotá. Codirector.

Marciales L. J.:
2006. Ecología funcional del fitoplancton en dos lagos de la ribera colombiana del Río Amazonas (Tarapoto y El Correo). Tesis Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá. Director.

Manjarrés-Hernández A. M.:
2005. Análisis de la inversión en carnivoría desarrollado por la planta acuática Utricularia foliosa (quebrada y lagos de Yahuarcaca - Río Amazonas, Colombia). Tesis Depto. Biología Universidad del Magdalena, Santa Marta. Tesis Meritoria. Director.

Aldana M. & E. Daza.:
2005. Dinámica fluvial del río Amazonas sector Colombiano (Casos específicos Isla Mocagua, Isla La Fantasía). Tesis Departamento de Geografía Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá. Director.

Díaz-Olarte J. J.:
2008. Fitoplancton asociado a la planta carnívora Utricularia foliosa (Amazonas Colombiano)¿. Tesis Universidad Industrial de Santander Bucaramanga. Director.

González A. E.:
2007. Influencia de Utricularia foliosa sobre la diversidad zooplanctónica en las dimensiones longitudinal y temporal de la Quebrada Yahuarcaca (Amazonia colombiana). Tesis Licenciatura en Biología. Universidad Distrital Francisco José de Caldas, Bogotá. Tesis meritoria. Asesor Externo.

Jiménez A.:
1992. Elaboración del diseño de un sonoviso en ecología amazónica. Universidad Pedagógica Nacional. Bogotá. Director.

Andrade C. et. al.:
1992. Estudios limnológicos en el páramo de Chisacá. Universidad Pedagógica Nacional. Bogotá. Asesor.

Villa, L. A.:
1991. Caracterización fisicoquímica y biológica de los sistemas lóticos de la cuenca del río Gualí (Tolima, Colombia). Universidad Javeriana. Bogotá. Director.

Naranjo C. P.:
1991. Caracterización química de macrófitos acuáticos de la dársena de la planta de tratamiento de agua de Tibitó. Universidad Javeriana. Bogotá. Codirector.

Escobar, B. N.:
1990. Composición del fitoplancton de la laguna de Suesca. Universidad Javeriana. Bogotá. Director.

Rodríguez, C. L.:
1990. Distribución del fitoplancton y aspectos fisicoquímicos del embalse de Chuza. Universidad Javeriana. Bogotá. Codirector.

Arias-Builes M. J.:
2022. Assessment and perspectives of the environmental quiality of the urban and suburban wetlands of Leticia (Amazonas, Colombia). Trabajo de grado Ingeniería ambiental UNAL- Medellín. Mejor trabajo de grado Ingeniería Ambiental UN Sede Medellín 2022 (Resolución 16 de 20-05-2022). Codirector.

Cohen I.:
2010. Influencia del pulso de inundación y la conectividad con el río Amazonas sobre el ensamblaje de rotíferos planctónicos, en cuatro lagos amazónicos colombianos. Tesis Universidad del Cauca, Popayán. Asesor Externo

Pantoja Matta Á. L.:
2010. Influencia del pulso de inundación sobre las comunidades planctónicas de los lagos peruanos Caballo Cocha y Cushillo Cocha (Cuenca del río Amazonas). Tesis Departamento de Biología, Universidad del Cauca, Popayán. Asesor externo.

Flórez P. C.:
2010. Efecto del enriquecimiento de nitrógeno y fósforo sobre el ensamblaje fitoplanctónico en mesocosmos en el lago Yahuarcaca (Leticia Amazonas Colombia). Tesis Departamento de Biología, Universidad del Cauca, Popayán. Asesor externo.

Henao Duque E. C.:
2010. Influencia del pulso de inundación y la conectividad sobre el ensamblaje de microcrustáceos planctónicos, en cuatro lagos amazónicos colombianos. Tesis Universidad del Cauca, Popayán. Asesor Externo.

Medina M. F.:
2008. Variación temporal de la eficiencia fotosintética en la laguna Aguas Tibias, por medio de la relación productividad primaria / biomasa. Universidad del Cauca, Popayán. Asesor Externo.

Montenegro D.:
2008. Efecto del enriquecimiento con nutrientes en la dinámica del fitoplancton del lago ecuatorial Yahuarcaca, Amazonas - Colombia. Universidad del Magdalena, Santa Marta. Tesis Meritoria. Director.

Leguízamo Betancourt B. M.:
2008. Caracterización de la comunidad fitoplanctónica de la ciénaga de San Sebastián, Complejo Cenagoso del bajo Sinú, Departamento de Córdoba ¿ Colombia. Tesis Biología Universidad de Córdoba, Montería. Asesor.

García V. M.:
2008. Estudio de la comunidad fitoplanctónica de dos lagos amazónicos: Zacambú y Yavarí. Depto. Biología Universidad Pedagógica Nacional. Bogotá. Codirector.

Donato J CH & Duque SR:
1986. Estructura y dinámica del fitoplancton de la laguna de Fúquene, Cundinamarca, Colombia. Tesis UNAL Bogotá

Ramos R. M.:
1999. Contribución al conocimiento de la ecología alimenticia de los delfines de río Inia geoffrensis y Sotalia fluviatilis en algunos sistemas lénticos de la Amazonia colombiana. Tesis Universidad Nacional de Colombia. Santafé de Bogotá. Director.

Camacho K.:
1998. Estudio del fitoplancton en algunos ambientes acuáticos del río Metá (Caquetá Medio) Amazonia colombiana. Tesis Universidad Nacional de Colombia. Santafé de Bogotá. Director.

Lagos L.:
1997. Productividad primaria y biomasa fitoplanctónica en el lago Yahuarcaca (Amazonia colombiana). Tesis Universidad Nacional de Colombia. Santafé de Bogotá. Codirector.

López C. M.:
1996. Determinación de la biomasa de las diferentes fracciones fitoplanctónicas en la Laguna de Fúquene (Colombia). Universidad Pedagógica Nacional. Santafé de Bogotá. Director.

Díaz, M.:
1995. Caracterización limnológica preliminar de los lagos de Tarapoto, El Correo y Caballo Cocha, Amazonia central (Colombia - Perú). Tesis U. Jorge Tadeo Lozano, Santafé de Bogotá. Codirector.

Guamán S., Núñez M. y Solano D.:
1995. Contribución al estudio del estado trófico de las lagunas Verde y Seca (Parque Nacional Natural de Chingaza), a través de la composición, biomasa y productividad de la comunidad fitoplanctónica. Tesis U. Distrital, Santafé de Bogotá. Director.

Useche J. J.:
1994. Análisis de pigmentos clorofílicos y guía para el estudio del fitoplancton en la laguna de Pedro Palo (Cundinamarca, Colombia). U. Pedagógica Nacional. Director.

Jiménez, L. F.:
1994. Estructura de la comunidad íctica en gramalotes del Trapecio Amazónico colombiano. Universidad Nacional de Colombia. Santafé de Bogotá. Codirector.

Salinas Y.:
1994. Aspectos de la biología pesquera de las poblaciones de los grandes bagres en el sector colombiano del río Amazonas. U. Pedagógica Nacional, Tropenbos. Codirector.

Bahamón N.:
1994. Estudio limnológico, con énfasis en la comunidad de fitoplancton en algunos lagos de inundación del río Amazonas (Colombia). Universidad Nacional de Colombia. Director.

Torres J.:
2003. Caracterización ecológica de algunos ecosistemas de la cuenca del río Putumayo (Amazonia colombiana), a través del estudio del fitoplancton. Tesis Universidad Pedagógica Nacional. Bogotá. Codirector.

Rojas Y.:
2003. Comparación de la estructura de la Comunidad de Fitoplancton en varios lagos y ríos de la cuenca del Putumayo y Caquetá (Amazonia Colombiana). Tesis Universidad Nacional de Colombia, Bogotá. Director.

Araujo A. J.:
2003. Evaluación de las comunidades fitoplanctónicas en la laguna Moronacocha (Loreto ¿ Perú), durante el período de creciente. Tesis Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad Nacional de la Amazonia Peruana UNAP. Iquitos, Perú. Director.

Bustos O. E. & N. López-Hernández.:
Evaluación de tres niveles, 35, 40 y 45% de proteína en el pirarucú (Arapaima gigas) durante la etapa de alevinaje, con harina de pescado y/o torta de soya como fuentes de proteína. Tesis Zootecnia Universidad Nacional de Colombia. Bogotá. Codirector.

Roa N. J.:
2002. Estudio biológico pesquero de los pintadillos Pseudoplatystoma fasciatum (Linnaeus, 1766) y P. tigrinum, (Valenciennes, 1840) en la zona de influencia del municipio de Puerto Nariño (Naranjales, Boyahuazu y Siete de Agosto) en el río Amazonas colombiano. Tesis de Zootecnia. Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá. Director.

Gómez L. N.:
2002. Aspectos biológicos y económicos de la captura, transporte, acopio y comercialización de peces ornamentales en la ciudad de Leticia (Amazonia colombiana). Tesis Zootecnia. Universidad Nacional de Colombia, Bogotá. Codirector.

Piña N. E.:
2000. Elaboración de un hipertexto para el estudio del recurso agua en el Departamento del Amazonas. Universidad Pedagógica Nacional, Santafé de Bogotá. Director.

Gantiva J.:
2000. Estructura de la comunidad fitoperifítica en dos períodos hidrológicos del lago Yahuarcaca (Amazonia colombiana). Tesis Universidad Nacional de Colombia. Santafé de Bogotá. Director.

Marín Z.:
2000. Composición, biomasa y productividad primaria del fitoplancton del lago Tarapoto (Amazonia colombiana). Tesis Universidad Nacional de Colombia. Santafé de Bogotá. Director.

Amaya K.:
1999. Composición y la estructura de la comunidad fitoperifítica del lago Tarapoto (Amazonia colombiana) en dos períodos hidrológicos. Tesis Universidad Nacional de Colombia, Santafé de Bogotá. Director.

"Museo mundo del agua" - octubre 2016 en Museo mundo del agua, Universidad Nacional de Colombia, Sede Amazonia, Leticia, Colombia, septiembre 2016