En la propuesta de investigación planteada se desea profundizar sobre las rutas bioquímicas comprometidas en la resistencia poligénica de clavel ante el ataque de Fusarium oxysporum f. sp. dianthi (Fod) usando aproximación ómica que involucra secuenciación de ARN por medio de tecnologías de nueva generación, como son el RNA-seq y Ribo-seq. Estas técnicas que vienen siendo usadas desde hace varios años para el estudio de estrés en plantas durante su interacción con factores bióticos y abióticos, permitirán acercarse a aquellas respuestas que a la fecha no se han descrito en esta interacción planta-patógeno y pueden ser determinantes de la resistencia. Considerando que este abordaje permite analizar con una alta sensibilidad los cambios que se presentan en el transcriptoma celular, se espera que esta aproximación permita tener un acercamiento a la mayor cantidad de los procesos moleculares que a nivel del RNA se dan en este fenómeno biológico. De esta manera, se obtendrá información a la fecha desconocida, sobre los cambios cuantitativos en los perfiles de expresión totales de mRNA para determinar cuáles son aquellos genes que se transcriben de manera diferencial e inferir la mayoría de las rutas bioquímicas involucradas en la interacción clavel-Fod. Así mismo, el proyecto involucra la medición de parámetros fisiológicos asociados al marchitamiento vascular, enfermedad producida por Fod, los cuales no han sido descritos en la interaccion hasta el presente.