El propósito de esta investigación es el desarrollo de un modelo de transferencia de tecnología que reconozca las características y dinámicas de los actores de dos cadenas productivas con diferentes dinámicas, específicamente la del café y el aguacate, a las cuales se les reconoce que generan o pueden generar impacto desde el punto de vista económico dado su potencial; también por el grado de madurez disímil entre las cadenas, permitiendo explorar diferentes escenarios con un mismo modelo; permitiendo la validación del modelo usando comportamientos extremos; y por último, al facilitar la realización de experimentos del tipo “¿Qué pasaría si?”, que admiten identificar puntos de apalancamiento que mejoren el desempeño de las cadenas y orienten la formulación de políticas. El modelo tiene la bondad de incluir las dimensiones ambiental, social, cultural y económica del territorio, permitiendo explorar el efecto de las políticas de CTi en el desempeño innovador y económico de las cadenas productivas, buscando superar las limitaciones institucionales expuestas en el diagnóstico de CORPOICA [57], específicamente la fragmentación y dispersión de las instituciones y la inversión pública, la investigación redundante y orientada al corto plazo con poco impacto y escaso desarrollo tecnológico en la producción, la desarticulación de los procesos de I+D+i y de estos con el mercado, el escaso capital social necesario para la innovación, y el limitado seguimiento y evaluación de los procesos de I+D+i que dificultan la orientación de las políticas y su gestión. La metodología propuesta adopta un enfoque bottom-up propio de la MBA, donde inicialmente se deben caracterizar las especificidades los agentes, sus reglas de decisión y el relacionamiento con otros agentes; después formular los supuestos que representan el modelo conceptual; para posteriormente llevarlo a un modelo computacional; a continuación se validan los supuestos y el comportamiento del modelo; para finalmente analizar la emergencia y el desempeño innovador y económico de los experimentos realizados en los diferentes escenarios, con el fin de orientar las decisiones de política que puedan superar las limitaciones identificadas.