La capacidad de las cianobacterias para producir toxinas potentes asociadas con problemas de salud humana y animal, las han puesto en las prioridades para la gestión y protección de la calidad del agua (Codd, 2000). En los ecosistemas acuáticos, la mayoría de las toxinas están principalmente dentro de las células de las cianobacterias, pero pueden ser liberadas durante la lisis celular presentándose en altas concentraciones (Carmichael, 1992). En principio todas las cianobacterias son consideradas potencialmente tóxicas, y la ocurrencia de floraciones bioactivas traen intoxicaciones agudas en humanos y animales, y muchos casos han sido descritos en diversos países en todo el mundo (Codd 2005; Sant´Anna, 2006). En Colombia son pocos los casos reportados de floraciones tóxicas de cianobacterias, lo cual no indica que no se presenten, sino que existe desconocimiento acerca de estos procesos. Bula reportó en 1985 una proliferación de Nostoc comune (Anabaena flosquae) como responsable de un fenómeno de mortandad masiva de peces en dos lagunas del Magdalena. Botero et al. en 1995 reportan una floración de Anabaenopsis sp. ocurrida durante el 1994 sin que se presentara producción de toxinas. Comba en 2009 reporta presencia de microcystinas en el embalse de Betania, concluyendo que son necesarios más estudios para el diseño de un plan de manejo del embalse entre ellos estudios con especies aisladas. Reportes recientes indican que en los últimos años las floraciones han aumentado en número (Sant´Anna, 2006). Sin embargo en Colombia, aunque se han iniciado algunos estudios sobre cianotoxinas, no existe un sistema de identificación y monitorio de estas toxinas para los cuerpos de agua, en especial para embalses donde se toma el agua de las ciudades o humedales donde viven comunidades urbanas. Es por esto que el presente proyecto busca estandarizar protocolos de identificación y medición de cianotoxinas presentes en un sistema mesotrófico como es el Embalse de La Regadera, en contraste con un sistema eutrófico lagos recreacionales de Bogotá, ambos de importancia para la ciudad de Bogotá por ser el primero en centro de suministro de de agua potable y el segundo por estar rodeado de comunidades urbanas. Este proyecto vinculará un estudiante de la Maestría en Biología.