El Cáncer Gástrico (CG) es una de las principales causas de muerte por cáncer en la población colombiana (1). La quimioterapia neoadyuvante (NAC, por sus siglas en inglés) es ampliamente utilizada para el tratamiento del CG, sin embargo, la respuesta clínica del CG avanzado a NAC continúa siendo muy limitada (2). Si bien la inmunoterapia del cáncer es hoy el cuarto pilar de tratamiento del cáncer y dentro de ella las vacunas personalizadas basadas en neoantígenos tumorales son importante alternativa de tratamiento del cáncer (3), la inmunoterapia del CG con vacunas personalizadas aún no ha sido explorada y se espera que ella mejore el pronóstico de estos pacientes. En los últimos cinco años el Grupo de Inmunología y Medicina Traslacional (I&MT) Traslacional (http://investigacionimt.unal.edu.co), gracias a una alianza Universidad Nacional – Empresa (Fundación Salud de los Andes) – Estado (Minciencias) UEE, ha liderado el macroproyecto en Medicina Personalizada de Precisión (MPP) titulado Biomarcadores y vacunas para la inmunoterapia del cáncer en Colombia, en el que participan varios grupos del campus de la Sede Bogotá. En el marco de este proyecto hemos logrado (i) implementar el análisis in-silico del exoma y transcriptoma tumoral y de tejido sano necesarios para identificar el universo de mutaciones de un tumor y selección de neoantígenos dentro de estas mutaciones; (ii) adelantar dos estudios Clínicos Fase I de inmunoterapia con vacunas personalizadas basadas en neoantígenos en pacientes con cáncer de mama triple negativo (CMTN); (iii) impulsar la primera planta piloto para la producción de estas vacunas; (iv) implementar un sistema de monitoreo de la respuesta de linfocitos T estimulados por estas vacunas, basado en el análisis automatizado no supervisado de datos de citometría de flujo multiparamétrica; y (v) implementar distintos tipos de análisis del infiltrado tumoral en busca de biomarcadores pronósticos y de respuesta al tratamiento (Ver Anexo 1 Video de presentación del I&MT). Si bien estos resultados son importantes, la construcción y secuenciación de librerías de ADN (exoma) y ARN (transcriptoma) de tumor y tejido sano, debe ser contratada fuera del país a elevados costos (en términos económicos y de tiempo); y la necesidad de desarrollar y refinar de forma permanente las herramientas bioinformáticas necesarias para identificar y seleccionar los neoantígenos tumorales, base del diseño de las vacunas personalizadas, representan dos importantes desafíos para la futura consolidación en Colombia de nuestro trabajo. Por lo anterior, este proyecto persigue ampliar la alianza de varios grupos del campus de la Sede Bogotá, que ha permitido los desarrollos antes mencionados en CMTN, a grupos de las sedes de Medellín y Amazonía con el fin de implementar por primera vez en nuestro país la construcción y secuenciación de próxima generación (NSG) a alta profundidad de librerías de exoma y transcriptoma de tumores de CG (utilizado como tumor modelo) y tejido sano en un estudio preclínico con pacientes con CG tratados con NAC con el fin de (i) identificar neoantígenos en estos tumores para el diseño de vacunas personalizadas útiles para la inmunoterapia de estos pacientes en fases futuras de este proyecto y (ii) explorar la identificación de biomarcadores pronósticos de enfermedad y respuesta de los tumores al tratamiento. Confiamos que el alcance de los objetivos específicos de este proyecto contribuirá a alcanzar en nuestro país soberanía en el desarrollo de vacunas personalizadas y en el estudio de biomarcadores pronósticos y de respuesta al tratamiento de tumores de alta incidencia en nuestra población.