La investigación de diferentes técnicas para el mejoramiento de semillas de interés económico se ha enfocado progresivamente en la aplicación de procesos físicos entre los que sobresale el Tratamiento Magnético de Semillas (TMS). Posicionándose esta como una de las alternativas emergentes para fortalecer la producción de alimentos, sin generar contaminación ambiental. Para determinar las combinaciones de los diferentes parámetros de germinación se deben realizar una gran cantidad de experimentos de germinación in vitro. Sin embargo, el monitoreo efectivo de las variables involucradas en TMS es una tarea que se realiza generalmente de forma manual, lo que asocia al proceso fallas humanas, teniendo en cuenta la considerable cantidad de variables y combinaciones a realizar, y al monitoreo constante y repetitivo que se debe implementar. El presente proyecto pretende desarrollar un prototipo automático para el análisis de la germinación in vitro de semillas mediante un aplicativo de software de visión por computador acoplado con un sistema de registro automático de imágenes RGB y multiespectral, en incubadoras acopladas para TMS. Se pretende implementar un prototipo funcional, que inicialmente se probará sobre semillas de tomate, mediante la sinergia entre los grupos Investigación en Campos electromagnéticos, Medioambiente y Salud Pública, GruCalPro, ambos adscritos a la Universidad de Caldas, y el Grupo de Control y Procesamiento Digital de Señales de la Universidad Nacional de Colombia – sede Manizales. Los tres con amplia experiencia en procesos TMS y en sistemas automatizados, respectivamente. Esta propuesta propone la continuación de un trabajo que se viene desarrollando desde hace 10 años enfocados en el mejoramiento de semillas con campo magnético. Para lograr la posición actual se han integrado técnicas de inteligencia artificial para el diseño de experimentos, y se está terminado la automatización del proceso de exposición magnética de las semillas. Finalmente, cabe resaltar que además del componente innovador del prototipo, con amplio potencial social y económico, se generan productos académicos de impacto en el área y se vincularán estudiantes de maestría y pregrado, como soporte al fortalecimiento del capital humano de la región.