Proyectos
Validación de genes de resistencia candidatos a la bacteriosis vascular en yuca mediante VIGS
Resumen
La producción de biocombustibles representa una alternativa energética viable para reducir la dependencia del combustible fósil. En Colombia el suministro de bioetanol depende en su totalidad del empleo de la caña de azúcar como materia prima, lo cual solo alcanza a abastecer el 57% de la actual demanda local. Por esta razón es necesario buscar alternativas para la producción de bioetanol. El almidón de yuca presenta un alto potencial como materia prima alternativa. Además de su importancia en la producción de biocombustibles, la yuca constituye la base de la alimentación para más de 600 millones de personas en el mundo. Una de las principales limitantes en la producción de yuca es la bacteriosis vascular. Las pérdidas ocasionadas por esta enfermedad pueden comprometer el suministro de almidón para las plantas productoras de bioetanol y amenazar la seguridad alimentaria. Aunque existen variedades resistentes, éstas no poseen buenas cualidades culinarias y su rendimiento no las hace competitivas frente a otras variedades. A la hora actual no ha sido clonado y caracterizado el primer gen de resistencia de yuca a ninguna de sus enfermedades. Sin embargo, en los últimos años ha sido posible la identificación de dos genes de resistencia candidatos llamados RXam1 y RXam2, los cuales pertenecen a la familia de genes de resistencia LRR-STK y NBS-LRR respectivamente. RXam1 colocaliza con un QTL que explica el 13% de la resistencia a la cepa CIO136 de Xam y RXam2 esta asociado con un QTL que explica en 62% de la resistencia a la cepa CIO151. Los estudios de mapeo y expresión diferencial sugieren que ellos están implicados en la resistencia a la bacteriosis. Para confirmar que estos genes realmente juegan un rol en la resistencia es necesaria su validación funcional. A través del conocimiento del mecanismo de silenciamiento génico mediado por siRNA ha sido posible generar estrategias basadas en la pérdida de función de genes mediante silenciamiento génico empleando vectores virales, técnica conocida como VIGS (Virus Induced Gene Silencing). Recientemente se ha reportado la utilización de esta estrategia para determinar la función de genes en yuca, empleando en este caso, no vectores virales tradicionales, sino vectores basados en el Geminiviris que infecta naturalmente plantas de yuca. En este proyecto nosotros emplearemos este tipo de vector en el cual clonaremos los genes RXam1 y RXam2 para infectar inicialmente plantas de yuca resistentes y posteriormente realizar una infección secundaria con Xam y evaluar la pérdida de la resistencia, lo cual permitirá comprobar la función de estos genes.
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:CONVOCATORIA NACIONAL DE INVESTIGACIÓN 2008
Modalidad:MODALIDAD 1. APOYO A TRAVÉS DE PROYECTOS A GRUPOS DE INVESTIGACIÓN CONSOLIDADOS (CLASIFICADOS EN CATEGORÍA "A" EN EL SISTEMA NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA
Responsable