Conocedores de la problemática respiratoria en la industria avícola (pollo de engorde y ponedoras) el grupo se apoyará en el sector productivo para obtener muestras de órganos o de animales con síntomas compatibles con las enfermedades virales de incidencia en el tracto respiratorio tales como Bronquitis infecciosa, Laringotraqueitis infecciosa y Enfermedad de Newcastle, entre otras. El grupo de Microbiología y Epidemiología cuenta en este momento con la infraestructura y experticia para llevar a cabo pruebas como el aislamiento viral, serologías (prueba de ELISA), PCR convencional y PCR en tiempo real; el grupo de Biología de la Adaptación de Animales al Trópico, por su parte tiene fortalezas en el análisis histopatológico e inmuno-histoquímico, lo cual complementaría el estudio integral de las patologías de campo objeto de ésta alianza. La integración de éstos dos grupos clasificados por Colciencias como A1, que cuentan con experiencia en el desarrollo de investigación en el campo avícola reflejado en diversas publicaciones y en el número de estudiantes que han realizado sus tesis de pre y posgrado, crea una sinergia que brindará apoyo al sector avícola, contribuyendo de ésta forma al manejo de las enfermedades infecciosas que son una limitante de desarrollo para éste sector productivo del país. Tener a punto una serie de pruebas de laboratorio para el diagnóstico de enfermedades abre una gran expectativa a nivel investigativo, lo cual se verá traducido en el posible aislamiento de cepas de campo que pueden tener diferencias significativas con las vacunas convencionales de uso actual por estar diseñadas de acuerdo con cepas de referencia. Lo anterior implica que mediante el empleo de metodologías de tipo molecular se pueden establecer diferencias a nivel genómico para los diferentes agentes. Pruebas como PCR y PCR-TR ademásbrindan la posibilidad de que sin hacer aislamiento como tal se puedan detectar agentes virales con una alta confiabilidad y de manera rápida lo cual es importante para la toma de medidas sanitarias a nivel de las granjas avícolas que mejorarían el manejo preventivo y de control. Todo lo anterior se complementa a través del hallazgo de las lesiones microscópicas y verificación de la presencia del antigeno por métodos inmuno-histoquímicos . El proyecto busca igualmente fortalecer la formación de semilleros de investigación a nivel de pregrado mediante la integración de estudiantes en las diferentes etapas del desarrollo de la presente propuesta, generando posibles aspirantes al programa de posgrado con lo cual se contribuye a llenar un vacío en la formación de investigadores en un área en la que el país lo requiere. Otra fortaleza que se deriva de la propuesta es contar con un paquete diagnóstico que plantea la posibilidad de brindar un servicio de extensión integral al avicultor colombiano, inicialmente en enfermedades respiratorias pero que puede ser extendido a otras entidades de importancia para el sector productivo avícola.